Nature Genetics:发现人体内导致肝癌的易感基因

2010-08-03 00:00 · vito

生物谷Bioon.com 讯 由解放军军事医学科学院院长、中国科学院贺福初院士领衔的蛋白质组学国家重点实验室在肝癌研究领域又有重大科学发现。该实验室在人类染色体的一个特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。8月1日,国际顶级学术期刊Nature Genetics在线公布了

生物谷Bioon.com 讯 由解放军军事医学科学院院长、中国科学院贺福初院士领衔的蛋白质组学国家重点实验室在肝癌研究领域又有重大科学发现。该实验室在人类染色体的一个特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。8月1日,国际顶级学术期刊Nature Genetics在线公布了这一具有世界领先水平的原创性研究成果。次日,在军事医学科学院举行的新闻发布会上,蛋白质组学国家功能基因组学课题组研究员周钢桥介绍说,这一重大发现不但有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制,而且为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和生物靶标。

我国是肝癌高发国家,每年新发病例30万,占全球肝癌新发病例的半数以上。肝癌恶性程度高、病程进展迅速、易复发和转移,病人5年生存率仅在4%左右,肝癌仍是目前临床上治疗效果最不理想的肿瘤之一,俗称"癌中之王"。为找到并确认容易导致肝癌的遗传易感基因,周钢桥研究员带领的课题组联合南京医科大学、中国医学科学院肿瘤研究所、复旦大学、中山大学肿瘤医院、广西肿瘤医院、广西扶绥县肝癌研究所和江苏海门市疾控中心等10多家单位的100余位科研人员,在国内5个肝癌高发区收集了4500多名肝癌病例和对照个体,运用全基因组关联分析方法,在全基因组范围内进行了系统的筛选和实验验证。经过两年多的"大海捞针"式的潜心研究和艰辛探索,他们在人体第1号染色体的一个特殊位置发现了一个由多个基因组成的区域,这个区域是容易导致肝癌的"罪魁祸首"。论文第一作者张红星博士告诉记者:"如果该区域的基因发生了变异,人类患有肝癌的风险系数就会大大增加"。

这一重大研究成果的出炉,发出了中国科学家在人类重大疾病易感基因研究领域的最强音。贺福初院士介绍说,这项研究是国际上首次基于大规模人群和全基因组水平的肝癌易感基因的筛查研究,所使用的全基因组关联研究技术是目前全球科学界公认的行之有效的拉网式搜寻重大疾病易感基因的研究方法。此前,欧美多国利用该技术已经发现了近70种重大疾病的易感基因,在国际上掀起了重大疾病易感基因的"卷地毯式掘金浪潮"。

据悉,蛋白质组学国家重点实验室长期致力于包括肝癌在内的多种肝病的易感基因及其致病机理的研究,过去10年间已经在乙型肝炎病毒感染的慢性化和重症化等关键环节找到了易感基因。这次发表于《自然遗传学》(Nature Genetics)的论文是该团队近两年发表的第11篇Nature子刊论文,是肝病易感基因领域的又一重大原创性成果,进一步巩固了他们在此领域的国际领先地位。

贺福初院士表示,军事医学科学院将集成过去多年的研究成果,加大基础研究成果向临床、向人群应用的转化力度,积极造福于民众。

 

推荐原文出处:

Nature Genetics doi:10.1038/ng.638

Genome-wide association study identifies 1p36.22 as a new susceptibility locus for hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis B virus carriers

Hongxing Zhang1, Yun Zhai1, Zhibin Hu2,12, Chen Wu3,12, Ji Qian4,12, Weihua Jia5,6,12, Fuchao Ma7, Wenfeng Huang7, Lixia Yu1, Wei Yue1, Zhifu Wang1, Peiyao Li1, Yang Zhang1, Renxiang Liang8, Zhongliang Wei8, Ying Cui7, Weimin Xie7, Mi Cai1, Xinsen Yu9, Yunfei Yuan5, Xia Xia1, Xiumei Zhang1, Hao Yang1, Wei Qiu1, Jingmin Yang4, Feng Gong1, Minshan Chen10, Hongbing Shen2, Dongxin Lin3, Yi-Xin Zeng5,6, Fuchu He1,11 " Gangqiao Zhou1

To identify susceptibility variants for hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC), we conducted a genome-wide association study by genotyping 440,794 SNPs in 355 chronic HBV carriers with HCC and 360 chronic HBV carriers without HCC, all of Chinese ancestry. We identified one intronic SNP (rs17401966) in KIF1B on chromosome 1p36.22 that was highly associated with HBV-related HCC and confirmed this association in five additional independent samples, consisting of 1,962 individuals with HCC, 1,430 control subjects and 159 family trios. Across the six studies, the association with rs17401966 was highly statistically significant (joint odds ratio = 0.61, P = 1.7 × 10?18). In addition to KIF1B, the association region tagged two other plausible causative genes, UBE4B and PGD. Our findings provide evidence that the 1p36.22 locus confers susceptibility to HBV-related HCC, and suggest that KIF1B-, UBE4B- or PGD-related pathways might be involved in the pathogenesis of this malignancy.

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