最后一种类人猿的基因组完成测序
黑猩猩和倭黑猩猩是现存两种与我们人类关系最近的物种。这篇论文报告了倭黑猩猩的基因组序列，这种猩猩是最后一个基因组被测序的类人猿。计较基因组分析显示，人类基因组的3%以上与倭黑猩猩或黑猩猩的基因组之间的关系要比它们彼此之间的关系更近。这些结果为了解这两种类人猿物种的先祖提供了线索，并且最终还可能有助于了解人类与其中一种或另一种类人猿物种所共有的基因型的遗传基础。[查看论文]
抗-EGFR疗法中的获得性抗药性
本期Nature上两篇论文表明，K-Ras突变在临床抗药性/复发出现之前可以在患者血清中检测到。使用以“表皮生长因子受体”(EGFR)为目标的抗体，已成为治疗结肠直肠癌的一种成熟方法，但它们不能用于KRAS致癌基因上携带突变的患者。抗药性还会在最初有疗效的患者身上出现。本期Nature上两篇论文提出的明确证据表明，KRAS基因的突变是造成很多患者对“抗-EGFR抗体”产生获得性抗药性的原因。Misale等人通过细胞系模型发现，KRAS突变会造成对“西妥昔单抗”（cetuximab）的抗药性。在用“西妥昔单抗”或“帕尼单抗”治疗的结肠直肠癌患者中，抗药性与从事先存在的亚克隆选择的KRAS突变有关或是在治疗过程中获得的。Diaz等人还发现，KRAS突变在对“帕尼单抗”有抗药性的患者中会积累。他们的数学模型表明，KRAS突变在治疗之前存在于肿瘤细胞中，这也许可以解释为什么临床复发通常是在治疗开始大约六个月后发现的——到这个时候，有抗药性的、携带KRAS突变的肿瘤细胞亚组就会扩大。这种明显无法避免的抗药性表明，如果要避免抗药性，将需要以一个以上致癌通道为目标的药物组合。[查看论文]
Argonaute蛋白在细胞核中的功能
微RNA(miRNA)与信使RNA发生相互作用来抑制基因表达。Amy Pasquinelli及其同事现在报告，miRNA还可以其他非编码RNA为目标。在线虫中，结合到Argonaute蛋白ALG-1上的成熟的let-7 miRNA在let-7前体的3\'端发生相互作用，促进其处理，形成一个正反馈环。这一发现首次为miRNA-loaded的Argonaute蛋白在细胞核中确定了一个功能。[查看论文]
自体免疫药物反应中的HLA目标
基于免疫的药物反应，如“阿巴卡韦超敏反应综合症” (AHS)和“卡马西平”-诱导的“Steven–Johnson综合症” (SJS)，已被与特定的“人白细胞抗原”(HLA)等位基因联系起来。本文作者介绍了一个机制，这些小分子药物通过该机制影响抗原呈现、进而影响T-细胞反应。通过以非共价方式与HLAB*57:01的“抗原结合缝”相结合，“阿巴卡韦”诱导这个点的形状和化学性质发生变化，因而改变内生肽对HLA的亲和性。最终，这将导致表现为AHS的系统性反应。研究人员发现，“卡马西平”也能与异形HLA-B*15:02结合、诱导一个类似的反应，这说明该机制具有普遍性。[查看论文]
酿酒酵母核小体的分布图
核小体在基因组DNA上的位置会影响染色体功能的很多方面。Kristin Brogaard等人建立了一种新颖的方法，来在全基因组范围内对酿酒酵母的核小体位置进行活体分析，其办法是利用高度局部化的羟基自由基来修饰工程改造的组蛋白。所获得的分布图以单碱基对的准确性限定了核小体中心的位置。核小体的精确位置被发现与各种不同的基因组特征相关，其中包括转位子集成点的精确位置以及RNA聚合酶的停顿点。[查看论文]
