转录组测序可全面揭示细胞或组织在特定状态下的几乎所有转录本及基因序列,可用于研究基因结构和功能、可变剪接、融合基因、新转录本预测等。为了让研究人员以更优惠的价格开展转录组研究,千年基因推出转录组测序聚划算活动,活动时间为4月1日-5月31日,欢迎大家前来体验低价风暴!
发表转录组文章解析:
1.A transforming KIF5B andRET gene fusion in lung adenocarcinoma revealed from whole-genome andtranscriptome sequencing, Genome Research.
为鉴定非小细胞肺癌的新分子靶标,本研究对患者的癌症组织和正常组织分别进行全基因组及转录组测序。该患者并未发现EGFR、KRAS、EML4-ALK融合基因等已知驱动突变,通过测序及数据分析发现了KIF5B与RET原癌基因之间通过10p11.22–q11.21臂间倒位产生的新融合基因。该融合基因过度表达嵌合的RET受体酪氨酸激酶,这种酶能自发导致细胞转化。在20个原发肺腺癌的验证研究中,在2个肺腺癌中鉴定到KIF5B-RET融合基因。

2. Transcriptomic screening for cyclotides and othercysteine-rich proteins in the metallophyte Viola baoshanensis, Journal of Plant Physiology.
富半胱氨酸蛋白(CRPs)一般与植物抗逆性相关,宝山堇菜是一种可以超富集镉的植物,但其以CRPs为基础的防卫机制却不是很明确。本研究通过转录组测序、de novo组装及注释鉴定了大量宝山堇菜的CRPs,通过GO功能注释以及Wego分类,2229个注释的的CRPs在细胞组分、生物过程和分析功能方面都分布,显示宝山堇菜的CRPs具有很高的多样性,为寻找这种超富集镉植物的敏感位点和防御物质提供了新视野。

