miRNA测序

2015-12-30 22:32 · satxam

小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。

小RNA测序服务

 

    小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。

    小RNA转录组测序目标:

        1. miRNA长度,茎环结构,miRNA前体加工,靶基因结合位点和预测;

        2. 转录组和小RNA数据的联合分析。

 

    一、技术流程

 

    二、生物信息学分析内容

        1. 测序质量分析与统计、评估;

        2. microRNA,rRNA,tRNA,intron,exon,snRNA,snoRNA注释;

        3. microRNA的表达量差异分析;

        4. microRNA表达模式聚类分析;

        5. microRNA保守性分析;

        6. microRNA与靶基因之间的调控, microRNA靶基因之间的蛋白-蛋白相互作用网络分析;

        7. 靶基因预测;

        8. 新miRNA预测。

 

    三、结果展示

        1. 数据库使用

        2. 版图展示

        图1.1所示,反映样品间相似性,以及各miRNA的表达模式相似性;

图1.1 差异基因聚类热图

        图1.2所示,预测miRNA;

图1.2 miRNA预测

 

    四、样本要求

        总量:〉4 µg RNA;浓度:〉50 ng/µL


    五、贯善生物拥有对本内容最终的解释权(贯善生物 冼华芬)