上海研究者告诉世界:Exosomes里也有环状RNA

2015-08-13 11:48 · JimmyFrank

复旦大学肿瘤研究所的黄胜林及何祥火课题组首次发现了exosomes内含有大量circRNA,相关报道已发表于Cell Research。

  环状RNA(circRNA)是一种广泛存在的特殊的稳定RNA分子,可以参与调控哺乳动物的基因表达;Exosomes是起源于内吞的小膜性囊泡, 许多类型的细胞均有分泌,它与circRNA都是近年的研究热点。复旦大学肿瘤研究所的黄胜林及何祥火课题组首次发现了exosomes内含有大量 circRNA,相关报道已发表于Cell Research
  研究者从MHCC-LM3肝癌细胞以及此细胞来源的exosomes中分别提取总RNA(去除核糖体RNA),进行RNA-seq分析,发现exosomes中的circRNA比exosomes来源细胞中的circRNA丰富得多。


A:Ciroc 图显示细胞和细胞来源exosomes中的circRNA;D:circRNA与线性RNA的比例,在exosomes中比细胞中高6倍。

  研究者把exosomes中的circRNA称为exo-circRNA。Exo-circRNA是来源细胞中的circRNA的2倍以上;而且进入exosomes的circRNA比线性RNA更多。
   据报道CircRNA能与miRNA结合,而miRNA在exosomes中也很丰富,于是研究者进一步研究了circRNA与miRNA之间的关系。 CDR1ascircRNA已知为miR-7海绵,研究者转染miR-7模拟物(由锐博生物合成)进HEK293T细胞,检测了CDR1as在细胞和 exosomes中的水平。有趣的是,研究者发现miR-7使CDR1ascircRNA在exosomes中大幅下调,但在细胞中下调轻微,表明 circRNA进入exosomes的分选是受调控的,至少有部分是通过改变来源细胞的相关miRNA水平来调控的。


HEK293T细胞转染miR-7模拟物后,细胞的CDR1AS及细胞来源exosomes的CDR1as水平

  除了细胞来源的exosomes,研究者发现人血清exosomes也含有大量完整稳定的circRNA,并且结直肠癌病人血清exosomes中的 circRNA与正常人差异明显,肿瘤来源的exo-circRNA有望成为癌症检测的潜在生物标志物。科学家们可进一步了解exo-circRNA的功 能,寻找潜在的应用功能。锐博生物在全球领先研发出外周血循环exosome RNA富集和提取技术,并结合微量RNA建库测序技术,提供exosomalmiRNA和exosomallncRNA研究整体解决方案,为广大的生物医 学研究提供最前沿和高质量的技术服务。

原文:Li Y, Zheng Q, Bao C, et al,.Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis.Cell Res. 2015 Aug;25(8):981-4.

通讯作者:
黄胜林研究员

       简介:2013年9月起任复旦大学生物医学研究院和复旦大学附属肿瘤医院/肿瘤研究所PI。主要从事非编码RNA调控网络及应用基础研究。入选上海市青年科技启明星及上海市卫生系统优秀医学青年人才培养计划,获国家自然科学基金资助。目前已发表文章20余篇,主要研究成果发表于Nature Cell Biology, Hepatology, Nucleic Acids Research, Oncogene, Int J Cancer 等专业杂志上。作为主要完成人获教育部自然科学奖二等奖及上海医学科技奖二等奖。
  研究方向:消化系统恶性肿瘤发病的分子机制研究,主要研究方向包括:1. 非编码RNA调控网络及其机制研究;2. RNA介导的基因组编辑技术及其在肿瘤中的应用研究。

何祥火教授
       简介:
2006 年至2013年任职于上海市肿瘤研究所癌基因及相关基因国家重点实验室,研究员,PI。2014年1月起任职于复旦大学生物医学研究院及复旦大学附属肿瘤 医院/肿瘤研究所,教授,博士生导师。国家杰出青年科学基金获得者。曾入选教育部新世纪优秀人才支持计划、上海市优秀学术带头人计划、上海市浦江人才计 划、上海市教委曙光学者、上海卫生系统优秀学科带头人计划;曾获吴孟超医学基金奖一等奖、银蛇奖、明治生命科学奖;曾获教育部自然科学奖二等奖及上海医学 科技奖二等奖。发表SCI论文70余篇,主要研究成果发表于Nature Cell Biology, Gastroenterology, Hepatology, Cell Research, Cancer Research, Nucleic Acids Research, Oncogene, Clinical Cancer Research, Oncotarget, Molecular Oncology, Carcinogenesis 等国际学术期刊。
  研究方向: 从事消化系恶性肿瘤发生与转移的分子机理研究,主要研究方向包括:1,非编码RNA调控网络及其分子机制;2,癌基因鉴定、功能与细胞信号转导;3,肿瘤基因组学与生物信息学。