罗氏推出全新的NimbleGen AccuSNP基因分型芯片

2012-06-06 13:59 · moon

罗氏推出全新的NimbleGen AccuSNP基因分型芯片,该芯片是NimbleGen芯片家族中最新成员之一,提供单核苷酸多态性(SNP)分型解决方案。这款芯片的优势在于:可根据用户的人类或者其他物种研究需要提供个人化设计,同时低芯片起定量,最小12个样本,让用户可以自由决定实验的样本量,对研究经费有更多掌控。

利用芯片技术对于已知位点的突变进行快速分型,是目前基因芯片的热点应用之一,是后 GWAS研究的一大领域,可以通过大量样本的数据进行有统计学意义的疾病相关研究。基因芯片的基因分型好处在于快速、准确、简便,实验报告为定性,结果一目了然。

NimbleGen AccuSNP基因分型芯片是NimbleGen芯片家族中最新成员之一,提供单核苷酸多态性(SNP)分型解决方案。这款芯片的灵活性,以及不同于其他同类产品的优势在于:可根据用户的人类或者其他物种研究需要提供个人化设计,同时低芯片起定量,最小12个样本,让用户可以自由决定实验的样本量,对研究经费有更多掌控。

基于NimbleGen基因芯片的技术优势及经验,此次芯片的实验流程也采取了新颖的设计:1)探针为‘发卡’结构,2)利用双酶检测,酶切及酶连接(见下图)。双酶技术以及‘发卡’探针保证了基因分型的准确性和重现性。实验所需配套的耗材和试剂也一应俱全。

该系列产品目前分为两大类:定制型芯片和目录型。就定制性SNP芯片而言,人类基因组可从多达13,500个SNP位点进行选择。而用户所关心的,定制性芯片上的探针是否能有效工作,也有专门解决方案,设计完一套探针时提供有每个探针质量信息,主要决定于SNP在基因组的位置。用户可以根据这些信息,为芯片选择“good probes”,以此可保证90%以上的高质量数据。此次推出的目录型芯片针对药物代谢相关的基因,有覆盖800个基因的这款芯片结果稳定可靠。

AccuSNP芯片的格式为12plex,即可同时检测12个样本。 但是芯片没有起订量的限制,即使是定制型的芯片,也可一张起订。您可以自由选择项目的样本通量 ,从及时到数百样本,乃至成千上万,而不像市场上的同类产品有最低数量的限制研究规模。

在实验数据分析方面,免费的DEVA软件提供完整地解决方案,从图像数据提取处理到最终SNP信息分析浏览。DEVA自动化的分析流程,只需简单点击,可以快速获得最终SNP报告,是您可以将更多时间用于结果的生物意义解读。

随着这款基因分型芯片的问世,NimbleGen基因芯片类型种类更加齐全,建立包括NimbleGen杂交仪、扫锚仪在内的仪器设备实验平台,可以一平台多用地尽情进行各种芯片实验。