| 研究领域 | 年份-期刊 | 影响因子 | 项目名称 | 合作单位 | 文章链接 |
| 基因组 | 2015 Nature Biotechnology | 39.08 | 棉花基因组 | 南京农业大学 | link |
| 2014 Nature Biotechnology | 39.08 | 大豆泛基因组测序 | 中国农业科学院作物所 | link |
| 2012 Nature Biotechnology | 39.08 | 基因组拼接 | 北京大学 | link |
| 2012 Science | 31.48 | 人单精子基因组测序 | 北京大学 | link |
| 2014 Nature Genetics | 29.65 | 金丝猴基因组 | 中国科学院动物所 | link |
| 2013 Nature Genetics | 29.65 | 藏猪基因组+重测序 | 四川农业大学 | link |
| 2012 Nature Genetics | 29.65 | 西瓜基因组+重测序 | 北京农林科学院 | link |
| 2013 Nature Communications | 10.74 | 地山雀基因组测序 | 中国科学院动物所 | link |
| 2013 Current Biology | 9.92 | 白虎基因组重测序 | 北京大学 | link |
| 2014 Scientific Reports | 5.078 | 猪基因组重测序 | 四川农业大学 | link |
| 转录调控 | 2014 Genome Research | 13.852 | 人类次级胶质母细胞瘤转录组测序 | 北京天坛医院 北京大学 | link |
| 2013 Nature Structural & Molecular Biology | 11.63 | 人胚胎单细胞lncRNA+mRNA测序 | 北京大学 | link |
| 2015 Nature Communications | 10.74 | 小鼠肝癌mRNA测序 | 厦门大学 | link |
| 2012 Nature Communications | 10.74 | 猪基因组甲基化测序 | 四川农业大学 | link |
| 2014 Plant Cell | 10.66 | 小麦转录组+sRNA测序 | 中国农业科学院作物所 诺禾致源 | link |
| 2014 Genome Biology | 10.47 | 人全基因组甲基化测序 | 北京大学 | link |
| 2014 Journal of Pineal Research | 7.3 | 黄瓜DGE | 中国农业大学 | link |
| 2015 Plant biotechnology journal | 5.677 | 小球藻转录组 | 江苏省农科院 | link |
| 2015 Scientific Reports | 5.078 | 黄瓜DGE | 中国农业大学 | link |
| 2015 Scientific Reports | 5.078 | 产甲烷古菌dRNA-seq | 中国科学院微生物所 | link |
| 2015 Scientific Reports | 5.078 | 四膜虫转录组测序 | 华中农业大学 | link |
| 2014 Plant Molecular Biology | 4.072 | 苎麻比较转录组测序 | 中国农业科学院麻类所 | link |
| 2015 BMC Genomics | 4.04 | 小麦转录组测序 | 西华师范大学 | link |
| 2015 BMC Genomics | 4.04 | 家蚕转录组测序 | 重庆大学 | link |
| 2015 BMC Genomics | 4.04 | 金蝇转录组测序 | 华中农业大学 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 二斑叶螨small RNA测序 | 南京农业大学 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 猪骨骼肌甲基化测序 | 四川农业大学 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 兰花根互作转录组测序 | 广东农业科学研究院 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 沙生植物梭梭转录组测序 | 中国农科院 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 猪胚胎转录组测序 | 中国农业大学 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 钩藤转录组+DGE测序 | 东北农业大学 广西药物植物园 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 甜叶菊转录组测序 | 四川农业大学 | link |
| 2014 BMC Genomics | 4.04 | 牛转录组测序 | 中国农业大学 | link |
| 2013 BMC Genomics | 4.04 | 烟草无参转录组测序 | 南京农业大学 | link |
| 2015 BMC Plant Biology | 3.94 | 柑橘DGE测序 | 华中农业大学 | link |
| 2014 BMC Plant Biology | 3.94 | 中山杉无参转录组测序 | 南京林业大学 | link |
| 2013 BMC Plant Biology | 3.94 | 水稻转录组测序 | 武汉大学 | link |
| 2015 RSC Advances | 3.84 | 酿酒酵母DGE测序 | 中国农业大学 | link |
| 2015 RSC Advances | 3.84 | 猪转录组+small RNA测序 | 湖南农业大学 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 扇贝转录组测序 | 黄海水产所 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 薯蕷類无参转录组测序 | 华南农业大学 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 樱桃转录组+DGE测序 | 山东农科院果树所 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 柑橘发育转录组测序 | 浙江大学 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 砂生槐无参转录组测序 | 西藏大学 | link |
| 2015 PLOS ONE | 3.534 | 枸杞small RNA测序 | 中科院武汉植物园 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 梭子蟹无参转录组测序 | 中国水产科学研究院黄海所 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 蛋鸡DGE测序 | 河南农业大学 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 腾冲菌原核转录组测序 | 中国农科院 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 苎麻转录组＋DGE测序 | 华中农业大学 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 草鱼转录组＋DGE＋small RNA测序 | 上海海洋大学 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 紫花苜蓿small RNA测序 | 河南农业大学 | link |
| 2014 PLOS ONE | 3.534 | 沙棘属比较转录组测序 | 中国科学院成都生物所 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 猪small RNA测序 | 四川农业大学 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 蛙无参转录组测序1 | 中国科学院成都生物研究所 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 中华绒鳌蟹无参转录组测序1 | 中国科学院海洋研究所 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 中华绒鳌蟹无参转录组测序2 | 中国科学院海洋研究所 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 梭子蟹无参转录组测序1 | 中国水产科学研究院黄海所 | link |
| 2013 PLOS ONE | 3.534 | 羊转录组测序 | 中国农业大学动物科技学院 | link |
| 2014 Insect Biochem Mol Biol | 3.42 | 昆虫细胞系转录组测序 | 华中师范大学 | link |
| 2015 Fish & Shellfish Immunol | 3.034 | 草鱼无参smallRNA测序 | 上海海洋大学 | link |
| 2015 Fish & Shellfish Immunol | 3.034 | 鳕鱼发育转录组测序 | 大连海洋大学 | link |
| 2014 Insect Molecular Biology | 2.976 | 沃尔巴克氏菌-宿主互作转录组测序 | 南京农业大学 | link |
| 2014 Journal of Biotechnology | 2.884 | 果蝇幼虫DGE测序 | 华南农业大学 | link |
| 2014 Journal of chemical ecology | 2.462 | 成年大螟转录组测序 | 南京农业大学 | link |
| 2015 International Journal of Molecular Sciences | 2.862 | 水稻转录组测序 | 中南大学 | link |
| 2015 International Journal of Molecular Sciences | 2.862 | 猪肌肉纤维small RNA测序 | 四川农业大学 诺禾致源 | link |
| 2015 International Journal of Molecular Sciences | 2.862 | 江豚转录组测序 | 中国科学院水生生物研究所 | link |
| 2015 International Journal of Molecular Sciences | 2.862 | 水稻转录组测序 | 湖南杂交水稻研究中心 | link |
| 2015 Plant Physiol Biochem | 2.756 | 山葡萄转录组测序 | 中国农业大学 | link |
| 2015 TREE GENET GENOMES | 2.451 | 桃DGE测序 | 浙江大学 | link |
| 2013 Biochem Biophys Res Commun | 2.281 | 大豆DGE测序 | 中国农业科学院 | link |
| 2015 Gene | 2.2 | 苎麻抗逆转录组测序 | 中国农科院麻类研究所 | link |
| 2014 Gene | 2.2 | 鹅掌楸无参转录组测序 | 南京林业大学 | link |
| 2015 BIOCHEM SYST ECOL | 0.967 | 栀子SSR转录组研究测序 | 南京林业大学 | link |
| 2015 BIOCHEM SYST ECOL | 0.967 | 山核桃转录组测序 | 西北大学 | link |
| 2014 GENES GENOM | 0.565 | 桂花转录组测序 | 南京林业大学 | link |
| 微生物 | 2014 Cancer Research | 9.329 | 小鼠肺癌微生物16S测序 | 安徽省老年医学研究所 | link |
| 2014 New Phytologist | 7.672 | 稻瘟病菌真菌重测序 | 中南大学 杂交水稻国家重点实验室 | link |
| 2015 water research | 5.528 | 高硝酸盐污水处理反应器的宏基因组测序 | 南京大学 | link |
| 2014 Environment Science and Technology | 5.481 | 土壤微生物宏基因组测序 | 浙江大学 | link |
| 2015 Scientific Reports | 5.078 | 三峡水体Meta测序 | 中国科学院水生所 | link |
| 2015 Scientific Reports | 5.078 | 家兔粪便16S测序 | 四川农业大学 | link |
| 2014 Bioresource Technology | 5.04 | 微生物燃料电池污泥16S测序 | 哈尔滨工业大学 | link |
| 2015Journal of Hazardous Materials | 4.529 | 苯甲酸降解过程中土壤微生物16S测序 | 广东农业环境污染综合控制重点实验室 | link |
| 2015Journal of Hazardous Materials | 4.529 | 莠去津处理土壤微生物16S测序 | 浙江大学 | link |
| 2015 Chemical Engineering Journal | 4.321 | 废水中反硝化细菌的宏基因组测序 | 南京大学环境学院 | link |
| 2015 frontiers in microbiology | 3.989 | 土壤细菌群落对铜污染的16S测序 | 中国生态环境研究中心 | link |
| 2014 Biogeosciences | 3.978 | 水驱油藏的16S测序 | 南开大学 生命科学学院 | link |
| 2014 applied microbiology and biotechnology | 3.811 | 大米稻田土壤16S测序 | 中国科学院地球化学研究所 | link |
| 2014 applied microbiology and biotechnology | 3.811 | 枯草芽孢杆菌基因组测序 | 天津大学 | link |
| 2014 PLoS ONE | 3.73 | 苹果树土壤16S测序 | 北京农业和林业科学院 | link |
| 2015 Journal of Geophysical Research | 3.426 | 稻田土壤16S测序 | 广州生态环境和土壤学研究院 | link |
| 2015 Appl Microbiol Biotechnol | 3.337 | 淤泥16S测序 | 中国科学院生态环境科学研究所 | link |
| 2014 Microbial Ecology | 3.12 | 中国孕妇生殖道微生物16S测序 | 南方医科大学 | link |
| 2015 Environ Sci Pollut Res | 2.828 | 长期镍污染的土壤16S测序 | 中国科学院生态环境研究所 | link |
| 2014 Ticks and Tick-borne Diseases | 2.718 | 硬蜱与小鼠互作样本微生物16S测序 | 浙江大学 | link |
| 2015 Applied Soil Ecology | 2.644 | 温室土壤的16S测序 | 南京农业大学 | link |
| 2015 Microbiology Open | 2.213 | 注水油藏的16S测序 | 南开大学生命科学学院 | link |
| 2014 Marine Genomics | 1.792 | 希瓦氏菌的细菌框架图 | 福建农业科学院 | link |
| 2014 Mitochondrial DNA | 1.7 | 猪线粒体基因组测序 | 四川农业大学 | link |
| 2013 Mitochondrial DNA | 1.7 | 欧洲松貂线粒体基因组测序 | 东北林业大学 | link |
