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  • 引物设计的原理与程序

    一、设计原理 1.选择合适的靶序列:设计引物之前,必须分析待测靶序列的性质,选择高度保守、碱基分布均匀的区域进行引物设计。 2.长度:一般来说,寡核苷酸引物长度为15-20bp. 3.Tm值:引物的Tm值一般控制在55-60℃,尽可能保证上下游引物的Tm值一致,一般不超过2
    2010/03/18
  • 引物设计原则

    1. 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。 2. 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基
    2010/03/18
  • SNP检测方法、前景和问题

    SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换;所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C
    2010/03/16
  • SNP(single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)概念和特点

    单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基
    2010/03/15
  • PCR 酶切位点保护碱基

    酶寡核苷酸序列切割率%2 hr20 hrAcc IGGTCGACCCGGTCGACCGCCGGTCGACCGG000000Afl IIICACATGTGCCACATGTGGCCCACATGTGGG0>90>900>90>90Asc IGGCGCGCCAGGCGCGCCTTTGGC
    2010/03/02
  • PCR 酶切位点保护碱基设计

    酶寡核苷酸序列切割率%2 hr20 hrNde ICCATATGGCCCATATGGGCGCCATATGGCGGGGTTTCATATGAAACCCGGAATTCCATATGGAATTCCGGGAATTCCATATGGAATTCCC000075750000>90>90Nhe IGG
    2010/03/02
  • 分子杂交(molecular hybridization)的概念和基本原理

    一、分子杂交的概念: 分子杂交(molecular hybridization)指具有一定同源序列的两条核酸单链(DNA或RNA),在一定条件下按碱基互补配对原则经过退火处理,形成异质双链的过程。 利用这一原理,就可以使用已知序列的单链核酸片段作为探针,去查找各种不同来源的基
    2010/01/31
  • 基因芯片技术基础知识

    生物科学正迅速地演变为一门信息科学。最明显的一个例子就是目前正在进行的HGP(human genome project),最终要搞清人类全部基因组的30亿左右碱基对的序列。除了人的遗传信息以外,还有其它生物尤其是模式生物(model organism)已经或正在被大规模测序,如大
    2010/01/22
  • 1月21日《自然》杂志精选

    封面故事:大熊猫“晶晶”基因组完成测序 北京奥运会吉祥物大熊猫“晶晶”基因组利用短序列测序技术完成测序,这在如此复杂的基因组中还是第一次。该基因组由24亿DNA碱基对组成(人类基因组为30亿),约含2.1万个蛋白编码基因(与人类基因组相似)。该序列所反映的基因组多样性水平很高,
    2010/01/22
  • 表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法

    人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基
    2010/01/18