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  • 昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法取得重大突破

    近日,昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法上取得新突破,这款针对三代测序技术的基因组装算法软件DBG2OLC测试表明,与目前用于三代测序最优秀的一些基因组装软件相比, DBG2OLC 在计算时间和内存空间的消耗通常仅为其它算法的1/10。
    2014/10/28
  • 三代测序技术:PacBio单分子测序最新科研动态

    DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。“第三代测序技术”的研发已有近十年时间,商业化的第三代测序仪上市也有三年,本文综述了“第三代测序技术”——PacBio单分子测序的最新科研动态与进展。
    2014/10/27
  • 三代基因测序:组装算法和软件研发获突破

    美国马里兰大学专家与中国科学院昆明动物研究所马占山研究员在“第三代测序技术”领域的合作研发取得新突破:产生了一种新的针对三代测序技术的基因组装算法,并开发出一款软件(DBG2OLC),该软件计算时间和内存空间的消耗通常仅为其它算法的1/10。
    2014/10/17
  • 高通量测序技术能淘汰PCR吗?

    ...量地产生垃圾。所以,即使有NGS,人们还是离不开PCR,更离不开mPCR. 除非是三代测序,做单细胞全基因组测序,而且能预先拿到疾病特异性的单细胞标本。那又是一个新的问题和挑战。换句话说,NGS不是要淘汰mPCR, 它更需要mPCR喂它充满疾病信号的文库来测序。如何更好地用mPCR配合NGS才是值得探讨的问...
    2014/06/23
  • PacBio第一季度售出9台仪器 收入翻番

    不论国籍,不论出处,不论广告与否,PacBio是现今为止已经商用了的三代测序,不论对其的褒贬,PacBio都是第一个推出三代且商用的公司,希望它进步,发展,带来让我们惊喜的产品和进步。
    2014/05/05
  • 基因梦工厂里那些年轻人:没上大学就做研究

    ...很多,“他们给你提供很多人生经验,敲打你,但是不干预你。”在华大,三代领导人分工很清晰。以汪建为首的、50多岁的那帮人,主要管宏观战略。汪建给华大定的战略是民生为天,围绕民生问题谋发展,他不主张做纯粹为满足好奇心的理论研究。王俊作为集团CEO,第二代领导人,要保证华大所有...
    2014/01/26
  • Nat Methods:结合二代测序三代测序来鉴定异构体

    ...平均长度(~2500 bp)。短的读取让人难以鉴定和定量异构体。而另一方面,三代测序尽管产生了很长的读取,但在原始数据准确率和通量上仍不尽如人意。为此,斯坦福大学Wing Hung Wong领导的研究小组将Illumina与PacBio的测序技术结合起来,来解决异构体鉴定和定量的问题。这篇题为“Characterization of the huma...
    2013/12/05
  • 基于纳米孔的第三代测序技术研究获新突破

    第一代基因测序技术耗时十几年,直接花费超过10亿美元。第二代基因测序技术仅需一周就能完成人类个体基因组测序,花费不到100万美元。近年来崭露头角的基于纳米孔的第三代基因测序技术凭借快速、精确、低成本的优势,有望完成NIH设定的只用1000美元完成个人基因组测序的目标。
    2013/12/05