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转录组测序问题集锦

...序技术的准确性较以前的技术有了很大提高,但仍然存在错误和噪声。比如内含区内有一些不连续的reads,很可能由系统噪声造成,如样品污染、测序错误和不恰当的read定位策略等。另外,外显区域内的read信号分布有时也很不均匀。有文献报道,序列组成尤其是GC含量、RNA二级结构等也有可能是导...

Illumina新品将临床相关基因一网打尽

凡云瑞 2013/10/12

...素淀粉样变的相关基因。TruSight Inherited Disease(遗传病)包括编码外显内含 - 外显边界在内的552个基因。TruSight遗传性疾病测序面板最初是以448种疾病为依据设计的。TruSight Autism(自闭症)靶向与自闭症及发育迟缓相关的101个目标基因。GE医疗首席医疗官评述

“细胞”开启“诺贝尔概念”炒作序幕

张勇 2013/10/08

...微丝推动原生质的环流、细胞器膜内外的物质交换,以及囊泡的形成与囊泡内含物的释放等。如光呼吸途径中,磷酸乙醇酸、甘氨酸、丝氨酸、甘油酸分别进出叶绿体、过氧化体、线粒体;叶绿体中的丙糖磷酸经Pi转运器从叶绿体转移至细胞质,并在细胞质中合成蔗糖进入液泡贮藏;在内质网和高尔基...

Science:行之有效的基因治疗方法

姜勇 2013/09/04

...γ逆转录病毒载体容易增加遗传毒性呢?最简单的解释可能是它们的基因组内含有长末端重复序列,其间存在着完整的启动序列和增强序列,当γ逆转录病毒载体被整合到宿主细胞内促生长基因的附近时,这些序列能够提高其转录水平,最终导致异常的细胞生长。一些临床试验对自我失活(self-inactiv...

Cell:揭示“垃圾”DNA控制细胞发育的分机制

陈芸芸 2013/08/06

...。信使RNA在翻译蛋白质之前需要被进行一定的加工,一般情况下,非编码的内含需要被切割来产生功能性蛋白质的最后序列,许多内含都包含有一些短的序列,俗称为终止密码,其可以阻止蛋白质重新连接形成。研究者使用计算机程序可以对mRNA保守的内含进行分类,同时他们也发现白细胞中的...

遗传学常用词汇

康加成 2013/04/07

...DNA的复制和相关蛋白质的合成,染色体呈现出染色质的形态即长的细丝状。 内含(Intro1):基因中除了外显,剩余的DNA序列就构成了内含内含被转录成RNA,但是接着就被剪切掉,因此内含不编码蛋白质。 体外(in vitro):在一个活体生物之外。比如DNA的体外复制,它不使用将外源DNA引入到...

历年博士入学考试生物化学及分生物化学试题

王楠昔 2013/03/26

...11. 比较原核生物与真核生物基因组结构的不同,并指出真核生物细胞的RNA内含剪接的主要方式。12. 激活酪氨酸蛋白激酶通路的配基类型及其作用区别;讨论信号转导通路中MAPKinase的地位13. 概述蛋白质分进化有哪些规律?协和医科大学2002年博士入学考试细胞生物学试题1、细胞连接包括几种类...

关于RNAi载体的最终确定序列问题

吴城 2013/03/17

最近在构建植物RNAi载体,通过BP反应将基因转入了pHGRV载体里面,然后得到很多克隆。但不知道怎么测序确定序列,因为重组入载体里的基因是反向重复的两个,中间是内含。想问下大家都是怎么确定的? 也可以通过测序,但加起来估计有3Kb,,,S所以想问下大家是否有其他更好的方法。

Y染色体发现隐藏序列

黄婷婷 2005/01/20

...来越多的问题和一些难以解释的现象。如先前的报道中基因组中的垃圾(如内含)发现了许多重要的基因,表明人类的基因组具有高度的复杂性。而有关Y染色体的研究最近十分热门,