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细数2011年基因组测序的物种

2011/12/20 来源:The scientist
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导读
细菌GFAJ-1去年非常风光,研究人员Felisa Wolfe-Simon和他的同事认为这种细菌不仅能够在富砷的环境里生存,它还可以将毒性元素整合到它的DNA里以代替磷元素。其他的研究人员对这一结论表示高度怀疑。

砷基生命

物种:GFAJ-1

基因组大小:350万对碱基

有趣的事实:细菌GFAJ-1去年激起千层浪,研究人员Felisa Wolfe-Simon和他的同事认为这种细菌不仅能够在富砷的环境里生存,它还可以将毒性元素整合到它的DNA里以代替磷元素。其他的研究人员对这一结论表示高度怀疑。由于这种细菌相比普通的大肠杆菌来说,具有更少的砷耐受基因,所以新的基因组不能平息争论。可能需要使用数据挖掘系统和建模系统,对基因组里大多数基因进行鉴定。

文献链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/wgs/?val=AHBC01

走进帝王蝶

物种:帝王蝶

基因组大小:2.73亿对碱基对

有趣的事实:帝王蝶基因组序列是首个被破译的蝴蝶基因组,有望解释帝王蝶每年如何完成从美国到墨西哥这史诗般的迁徙。为了完成这伟大的壮举,帝王蝶储存脂肪增加耐寒度从而延长寿命。新的基因组研究表明了帮助帝王蝶长途迁徙的基因:生物钟基因,方向性飞行的基因和对飞行方向的导航至关重要的化学传感器的基因。

文献链接http://www.cell.com/abstract/S0092-8674(11)01268-2

强大的螨虫

物种:叶螨

基因组大小:9000万碱基对

有趣的事实:叶螨是常见的农业害虫,受害物种有1100种农作物包括西红柿、辣椒和玉米。除了进化出产丝的能力,叶螨还有对植物进行解毒并且可以食用不同食物的基因,这可能有助于解释它贪婪无限制的食欲。

文献链接http://www.nature.com/nature/journal/v479/n7374/full/nature10640.html

顽固的链球菌

物种:肺炎链球菌突变株

基因组大小:210万碱基对

有趣的事实:耐青霉素的肺炎链球菌株会进化出了大量的和青霉素结合的蛋白。但是新的基因组表明这些为人所熟知的改变可能并不是抗药性的关键。相反,狡猾的细菌进化产生了其他抵抗青霉素治疗的方法,比如在铁代谢基因上的突变可以让它避免有毒性的活性氧的积聚。这种突变也让细菌可以抵抗一系列其他抗生素。

文献链接http://genomebiology.com/2011/12/11/R115/abstract

本土的药物

物种:蛹虫草

基因组大小:3220万碱基对

有趣的事实:蛹虫草又称为冬虫夏草,是一种传统中医药,以杀虫著称。这种真菌含有一种化合物,其在临床上具有抗癌作用。但是有关其生殖周期所知甚少,这就限制了其培养上的简单性。新的基因组研究表明不同的蛹虫草种个体有不同的性别,但是这种真菌可以进行无性繁殖。

文献链接http://www.biodiscover.com/news/genomics/library/10522

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