基因组分析对COVID-19临床试验具有重要意义
2020/04/07
英国布里斯托大学的科学家对新冠病毒SARS-CoV-2的遗传物质进行测序,以查明该病毒如何指示细胞制造病毒蛋白。

英国布里斯托大学的科学家对新冠病毒SARS-CoV-2的遗传物质进行测序,以查明该病毒如何指示细胞制造病毒蛋白,该蛋白既可以用来形成病毒颗粒,也可以减缓免疫反应,这对全世界进行疫苗试验的科研人员都具有重要意义。研究结果发表在预印本网站bioRxiv上。


https://doi.org/10.1101/2020.03.22.002204

在本文中,研究人员在实验室中繁殖了活的人类SARS-CoV-2病毒,使用Oxford Nanopore MinION进行直接RNA测序,确定了生长在猴子Vero E6细胞中病毒的转录组特征并使用最近开发的以ORF为中心的管道分析。当该病毒在猴子细胞中生长时,它可以对病毒表面上发现的蛋白质做出重大改变,这种蛋白质被称为“刺突糖蛋白”,可促进其进入宿主细胞,并且是免疫系统对抗病毒的重要靶标。他们还描述了病毒制造的许多蛋白质的一种重要修饰,称为磷酸化,可以改变病毒蛋白质的功能,并可能为治疗病毒的药物提供线索。有些药物就是通过改变蛋白质的磷酸化模式用于治疗疾病,它们理论上也可能改变感染者病毒蛋白的磷酸化模式并干扰病毒复制。


三聚体形式的野生型SARS-CoV-2刺突糖蛋白的空间填充模型,分别使用天然和刺突缺失病毒的序列

重要的是,这些发现对进行疫苗研究以及正在寻找合成抗体来治疗感染的科学家具有重要意义,因为当病毒在实验室中大规模生长时,可能会改变刺突糖蛋白,当这种突变的病毒被用于重要的动物临床试验时,可能使人们更难或无法了解疫苗或合成抗体是否有效,所以从事疫苗和药物测试的团队需要格外小心,以确保病毒在实验室生长时不会发生变化。

参考资料:

1.Genome analysis has important implications for COVID-19 clinical trials.

2.Characterisation of the transcriptome and proteome of SARS-CoV-2 using direct RNA sequencing and tandem mass spectrometry reveals evidence for a cell passage induced in-frame deletion in the spike glycoprotein that removes the furin-like cleavage site.

查看更多
发表评论 我在frontend\modules\comment\widgets\views\文件夹下面 test