Cell:基于流式细胞术的单细胞技术发现新型树突状细胞亚群
北京义翘神州 · 2019/11/14
在近期的Cell期刊发表新的研究成果,通过单细胞测序技术,通过转录组分析和染色质分析发现新的树突状细胞亚型,发现cDC2s有两种不同的亚群,拥有不同的分化和转录调控模式,以及不同的代谢特点和功能。

树突状细胞(DC)是抗原递呈细胞,未成熟细胞迁移能力较强,成熟细胞能有效激活初始T细胞。DC按照其功能主要分为cDC1s和cDC2s两个亚群。cDC1s细胞表面表达XCR1、CD8α、CLEC9A或CD103,分化依赖于IRF8和BATF3。cDC1s具有递呈抗原、促进CD8+T细胞功能。cDC2s表面表达CD11b、CD172α、SAM、CD301b或CLEC12A,分化依赖于IRF4和Notch,但对cDC2s功能异质性缺乏深入研究。


在近期的Cell期刊发表了题为“Tranional Basis of Mouse and Human DendriticCell Heterogeneity”的文章,通过单细胞测序技术,通过转录组分析和染色质分析发现新的树突状细胞亚型,发现cDC2s有两种不同的亚群,拥有不同的分化和转录调控模式,以及不同的代谢特点和功能。

本次研究将cDC2s定义为cDC2A和cDC2B两个细胞亚群,发现cDC2A表现出抗炎症反应,而cDC2B表现出促炎症反应。分析发现这两个细胞亚群会表达不同的趋化因子及其受体。cDC2B特异性的表达CXCL2、CCL6和CCL9,cDC2A表达CCL3,CCL4和CCL5。cCD2A能够高表达组织修复相关基因MMP9、Areg。cDC2B表达IL-1α和IL-27。在静息状态下,两群细胞都会表达MHCⅡ、共刺激分子和PD-L1。cDC2A受到CpG刺激后会表达较少的促炎因子。cDC2B则会在LPS刺激下高表达MHCⅡ和共刺激分子。用TLR7激动剂处理细胞发现,cDC2B分泌的TNF-α和IL-6细胞因子高于cDC2A细胞。两种细胞亚群与T细胞共培养后发现cDC2A促进T细胞向分泌IFN-γ和IL-17AT细胞分化的能力较弱。

这篇文章不仅发现了新型的DC亚群,在技术方法上也不同于传统的二代RNA-Seq测序,基于流式细胞术将细胞分选后分别进行的RNA-Seq测序,算是有一半的单细胞测序“血统”。本研究充分利用流式细胞术分析细胞表面和细胞内分子表达特征的优势,界定不同种类的细胞群,测定分离出的亚类纯度,分析细胞的大小和总量,同时分析单个细胞的多个参数。

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