速览 | 肠道病毒crAssphage解锁旅行打卡新技能
2019/07/11
圣地亚哥州立大学的研究人员发现crAssphage是人类肠道的世界性居民。

旅行可以开拓眼界,也可以改变肠道结构。

圣地亚哥州立大学的生物信息学研究员Rob Edwards教授带领的研究团队发现,一种叫做crAssphage的肠道病毒存在于全球70%的人口中,是一种具有特定国家的生物标志物。当人类从一个地方旅行到另一个地方时,这种标志物会迅速发生变化。他们的研究还表明,crAssphage的其它亚型生活在灵长类动物中,可能与人类一起进化了数百万年。这是全球第一个针对病毒在人类微生物组中全球相似性的研究,结果发表在《Nature Microbiology》杂志上。


https://doi.org/10.1038/s41564-019-0494-6

数字科学

Edwards和他的同事在2014年通过使用计算机软件而不是培养皿分析粪便样本发现了crAssphage的存在。这种数据驱动的方法表明,crAssphage不仅是“一个良性的环球旅行者”,而且是“正常人类肠道病毒的一个组成部分”。


Rob Edwards教授,图片来源:圣地亚哥州立大学

全球crAssphage 宝可梦

Edwards向科学界发出挑战,邀请他们加入到对crAssphage的全球寻宝行动中来。

反响非常热烈:来自六大洲65个国家的117名研究人员、临床医生和学者共同分析了32,273种不同的crAssphage序列,发现crAssphage也被称为噬菌体,是一种特异性感染细菌的病毒,是“人类肠道的世界性居民”。

这一发现的关键是由来自世界各地的志愿者组成的科学团体,他们通过检测本国污水处理厂、河流、湖泊和池塘的水,帮助实现了这一目标。

助力个性化医疗

Edwards说:“这一发现说明了病毒如何在地球上传播,并反映在我们的微生物群落中。我们才刚刚开始触及表面,但最终,我们可能能够操纵微生物群来攻击有害细菌。这将是迈向个性化医疗的关键一步。”

参考资料:

[1] A common gut virus that maps our travels

[2] Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

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