重磅!安诺优达引入全球首批Sequel II,助力三代测序技术应用
安诺优达 · 2019/04/24
4月22日,PacBio SMRT测序技术高峰论坛在京召开。

4月22日,PacBio SMRT测序技术高峰论坛在北京召开,本次会议上PacBio官方首次发布了备受瞩目的Sequel II测序平台。配置了全新的8M SMRT Cell,Sequel II单张芯片通量较Sequel平台提升了8倍左右,数据质量方面也有明显改善。安诺优达作为全球首批Sequel II 用户,见证了本次新平台的发布,并于今年5月底前正式对外提供Sequel II测序服务。


安诺优达首席运营官李大为先生(右二)参会并见证Sequel II全球首发

Sequel II 平台介绍

Sequel II平台仍旧采用了PacBio公司经典的SMRT 测序技术,将测序芯片SMRT cell进行了全新升级,芯片上的零模波导孔(ZMW)的数量由100万升级到了800万,大大提升了单张芯片的测序通量。目前Sequel II平台运行CLR (continuous long read)文库,采用10h的运行时间,单张芯片平均产出高达75Gb;而运行Hifi文库 (highly accurate long reads),采用30h的运行时间,单张芯片平均产出高达250Gb,较前一代Sequel平台有显著提升。


CLR和Hifi测序两种运行模式数据产出质量

数据质量

Sequel II平台除测序通量进行了大幅提升之外,测试数据质量表现也非常优异。PacBio SMRT测序时错误是随机发生的,后续的分析可以进行自身校正,测序深度的增加会显著提升reads的准确度。在Sequel II平台上,达到40X的测序深度,序列的准确度可达99.999%(Q50),另外由于SMRT测序技术为单分子测序技术,没有PCR扩增偏好性,因此对序列的GC含量没有偏好性,在高/低GC含量区域,覆盖仍旧非常均一。


Sequel II平台数据质量

应用方向

变异检测

SMRT测序技术由于其无PCR扩增偏好性和超长读长的技术特点,非常适合做检测结构变异检测,目前升级后的Sequel II平台采用Hifi 文库进行CCS测序能够显著提升碱基准确度,做到同时兼顾长读长和高准确度,除做结构变异检测外,能够适用于SNP、InDel等其它类型的变异检测。

基因组组装

PacBio SMRT测序已经成为目前基因组组装中广泛使用的技术手段,Sequel II平台的推出将使得基因组组装的成本进一步下降,结合CLR文库进行大片段测序,未来SMRT技术在基因组组装领域的应该将得到进一步的拓展。

全长转录组

全长转录组采用Sequel II平台的Hifi文库进行测序,单张SMRT Cell将产出更多的polymerase reads和更长的酶读长,通过CCS纠错,能够帮助研究者获得更多高质量的全长转录本,助力可变剪切、融合基因等的深入研究。

安诺实力

安诺优达基因科技成立于2012年,总部位于北京,是中国基因组行业知名企业,专注于新一代基因组学技术在人类医学健康和生命科学研究两大领域的产业化应用。自2017年安诺优达推出了三代测序以来,已经搭建了成熟的三代基因组组装、变异检测、转录组学、表观组学分析流程,并且积累了丰富的项目经验。尤其是针对于三代测序在医学上的应用,推出了基于三代人重测序为核心的多组学精准解决方案,不仅可以解析全基因组变异信息,进行表型相关性分析、显性/隐性遗传模式分析、复合杂合遗传模式分析以及靶向药物反应分析等,还可以通过与Hi-C、RNA-seq等多组学联合解析肿瘤、疾病发病机制,助力人类疾病与健康研究。

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