年终盘点,你不可不知的Hi-C大事件
生物探索 · 2018/12/28
2015年初,安诺基因在国内推出动物群体Hi-C和单细胞Hi-C测序服务,随后将人类染色体三维构象解析的分辨率提升至1kb水平,同年12月在国内推出植物Hi-C测序服务。四年来,安诺Hi-C技术不断发展,众多研究者利用安诺Hi-C技术取得了丰硕的成果。

2018年,三维基因组学研究进入快车道,在实验方法、大数据分析、信息共享等众多领域均有重大进展,作为三维基因组学研究领域的重要一分子,安诺Hi-C不忘初心,奋勇前行,全力迈向新高度。现在就跟着小编一起,细数2018年安诺Hi-C在三维基因组学时代留下的脚印吧~

4月

安诺Hi-C助力千种昆虫基因组计划

4月,在2018昆虫基因组与绿色防控大会上,中国农业科学院深圳农业基因研究组所联合浙江大学、西南大学等单位共同推出“TOP1000昆虫基因组计划”。安诺基因作为千种昆虫基因组计划的合作方,将协助完成基因组测序及组装等工作。

5月

安诺植物Hi-C文章见刊Plant Journal

5月,国内首篇商业合作的植物染色体三维互作文章发表,安诺基因联合东北师范大学合作研究的《Genome-wide Hi-C analysis reveals extensive hierarchical chromatin interactions in rice》见刊Plant Journal(IF:5.775),全面解析了水稻染色质的三维结构[1]。

5月

安诺Hi-C亮相2018年前沿基因组研究学术分享讨论会

5月,安诺优达联合福建农林大学基因组中心共同举办前沿农业基因组学术分享讨论会,安诺Hi-C技术亮相会场。

6月

安诺Hi-C在线交流教你分析软件哪家强

6月,安诺基因生物信息在线交流火爆开讲,Hi-C资深高级信息分析工程师亲自上阵,针对分析软件的使用方法、分析数据量等重点问题进行了详细解读。

7月

安诺Hi-C助力北京鸭登顶Nature子刊

7月,安诺Hi-C助力西北农林动物科技学院及中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,在北京鸭重要经济性状遗传机制解析上取得关键进展,研究成果见刊自然子刊Nature Communications,该研究被列为期刊当期的亮点推荐论文[2]。

8月

安诺Hi-C年中促销,让七夕更美

8月,安诺基因年中促销火力全开,Hi-C产品倾情放价,约“惠”七夕,科研生活不寂寞~

9月

首期三维基因组学信息分析培训班开班

9月,安诺基因首届三维基因组学信息分析培训班如期举办,来自全国各地的近50位老师相约安诺,与三维基因组分析团队的20位讲师共同开启染色质构象分析的生信大讲堂。

10月

安诺基因成功协办第五届国际三维基因组学研讨会

10月,第五届国际三维基因组学研讨会在湖北省武汉市华中农业大学隆重召开,安诺基因作为大会协办单位和指定赞助商,连续3年协助该国际会议的举办,我们真诚希望能与国内外学者一起促进三维基因组学领域的合作与交流,推动三维基因组学技术在国内的发展和进步。

10月

三维基因组学信息分析培训班再开班

9月的Hi-C生物信息分析培训班,因报名火爆场地有限,很多小伙伴没有参加,应各位老师的强烈需求,10月,Hi-C生物信息分析培训班再次开班,30天连开2次的培训班,小编也是没想到这般火爆呢,在此小编再次感谢大家的热情参与,来年我们还约哦~

10月

安诺Hi-C亮相第三届ISEMHH大会

10月,由南方科技大学主办,湖北大学、广东省生物信息学会和安诺优达协办的第三届国际表观遗传学机制与人类健康大会(ISEMHH)在广东深圳隆重召开。安诺基因Hi-C测序技术亮相此次大会,与业界大咖一起共议三维基因组学的当下与未来。

11月

安诺Hi-C辅助组装再添高分文章

11月,安诺Hi-C助力中国中医科学院中药研究所陈士林研究员课题组组装获得了穿心莲269M高质量染色体水平的参考基因组,研究成果见刊Plant Journal(IF=5.775)[3]。 

11月

Hi-C升级一小步,产品优化一大步

安诺Hi-C在建库流程和数据分析上进行了全面升级,升级后的标准分析将涵盖6大领域,针对染色质结构特征进行全方位、多角度的可视化展示;升级后的高级分析实现30+分析条目,继续扩大Hi-C与其他组学分析的深度联合。

12月

Hi-C建库起始量低至10万个细胞,降低建库起始量我们是认真的

12月,经安诺基因研发团队的全力优化,成功将细胞类型Hi-C样本的建库起始量由原来的500万个细胞降至10万个细胞。不过小编负责任的宣布,10万个细胞建库远不是安诺的终极目标,小编在此预告,来年还会有更大的惊喜哦~

安诺Hi-C文库数量破3000,前行的路上我们不松懈

截至2018年底,安诺Hi-C文库数量已突破3000个,样本类型全面涵盖人、动物、植物、微生物,正所谓聚沙成塔、积水成渊,一年虽末,但在前行的路上,安诺Hi-C从无终点。

写在最后

年年岁岁,岁岁年年,在2018即将落幕之际,安诺Hi-C团队衷心感谢一年来合作和支持我们的所有伙伴们,2019,愿我们一起不负努力不负己~

关于安诺Hi-C

2015年初,安诺基因在国内推出动物群体Hi-C和单细胞Hi-C测序服务,随后将人类染色体三维构象解析的分辨率提升至1kb水平,同年12月在国内推出植物Hi-C测序服务。四年来,安诺Hi-C技术不断发展,众多研究者利用安诺Hi-C技术取得了丰硕的成果。作为国内三维基因组测序技术的服务提供商,安诺基因与法国居里研究所、中国农业大学、中科院动物所、西南大学、南京医科大学等多家科研院所深度合作,相关研究成果已发表在Nature、Genome Biology、Molecular Plant、Nature Communications等国际高水平期刊,累计IF 97.19,平均IF 12.12。安诺Hi-C,期待与您一起换个视角做测序,共同探索染色质三维结构之美。

参考文献:

[1]Dong Q L, Li N, Yuan Z, et al. Genome-wide Hi-C analysis reveals extensive hierarchical chromatin interactions in rice[J]. Plant Journal, 2018. doi: 10.1111/tpj.13925

[2]Zhengkui Zhou, Ming Li, Hong Cheng, et al. An intercross population study reveals genes associated with body size and plumage color in ducks[J]. Nature Communications. 2018, 9: 2648

[3]Wei Sun,Liang Leng,Qinggang Yin,et al. The medicinal plant Andrographis paniculata genome provides insight into biosynthesis of the bioactive diterpenoid neoandrographolide[J]. Plant Journal, DOI:10.1111/tpj.14162.

文章来源:安诺基因


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