JAMA:基因检测不是“静态”的,近1/4“意义不确定突变”被重新分类
2018/09/28
近日,一项回顾了145万人的遗传性癌症基因测序结果的研究发现,近25%的“不确定重要性的突变”(variants of uncertain significance)之后被重新分类,其中大多数会降级为“良性”。


Theo Ross博士(左)和遗传学顾问Jacqueline Mersch认为,遗传咨询并不是“静态”的,基因检测实验室应该在获得新信息时重新审查测序结果。(图片来源:UT Southwestern)

9月25日,《Journal of the American Medical Association》期刊发表了这一篇题为“Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing”的文章。来自于德克萨斯大学西南医学中心的科学家们根据研究结果强烈建议:当科学知识得到发展、基因被重新分类时,基因检测实验室应该定期回顾其测序结果,并给医生提供相关信息。

他们回顾145万人的遗传性癌症基因检测结果发现,近25%的“不确定重要性的基因突变”随后被重新分类——有些与癌症相关的可能性较低,有些与癌症相关的可能性较高。


基因突变源于细胞分裂,但是并不是所有的变异都与疾病有关,它们被分成“良性”、“可能良性”“不确定重要性的变异”、“可能致病”和“致病性的”。

“如果一个突变被重新归类为致病性的,那么对于患者而言意义是不同的。”文章作者、内科教授Theo Ross表示,“例如,如果患者携带一个Lynch综合征突变基因,他们则需要一个不同的治疗方案——在更早的年龄或者更频繁的进行结肠镜检查;又或者如果携带BRCA突变基因,患者或许会选择预防性手术或者接受超声检查等。”

典型的基因约包含27000个碱基对(A-T,G-C),这些大量的碱基对意味着无数的潜在变异。随着高通量肿瘤测序和胚系基因检测的广泛应用,如何应对临床意义不明确的基因突变,是大家面临的挑战之一。“我们一直在获取新的数据,可能会发现有遗传易感性的新家庭,并从他们的DNA突变中学习到新的知识。” Theo Ross博士解释道。

这项研究回顾了2006年-2016年间Myriad Genetics实验室以及西南医学中心癌症遗传学项目的相关临床数据。总体而言,24.9%的“不确定重要性的变异”被重新分类,其中大多数降级为良性。

这项研究提醒医生需要知道关于基因突变的知识更新有多快,重新分类很常见。同时,独立的商业型实验室需要定期检查基因突变数据,并提醒医生注意重新分类。即便从“不确定”重新分类为“良性”,对于病人来说也很重要,因为可以让他们安心。

责编:悠然

参考资料:

Genetic testing: Not a one-and-done deal

Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing

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