中科新生命蛋白质甲基化检测小课堂开课咯!
中科新生命 · 2017/11/01
甲基化检测随心选~

中科新生命,成立于2004年,专注于质谱技术方法在科技服务、生物医药、精准医疗领域的应用开发。13年质谱服务经验,每年处理样本数超万例,通过与中科院的技术合作及企业研发团队的自主创新,致力成为您最具价值的生物技术合作伙伴。

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甲基化(Methylation)作为一种耳熟能详的翻译后修饰类型,大家可能并不陌生,但是如果您需要运用质谱这种时髦的技术来检测甲基化,您知道有哪些的不得不知的小秘密吗?今天我们就来给大家说说甲基化质谱检测哪些事儿~!


什么是甲基化?

甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,具有调节基因的表达和抑制,调控转录,DNA修复等多种功能,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病息息相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。其中最常见的甲基化修饰类型是DNA甲基化和组蛋白甲基化。大家如果去检索与甲基化相关的资料文献时,可以发现此类甲基化的文献大把大把的。那么甲基化是否只能发生在和遗传相关的染色体一些元素上吗?当然不是,在非组氨酸甲基化也是生物体内非常重要的一种翻译后修饰,现在也有越来越多被开发和应用于甲基化的检测。

 

一:甲基化修饰的氨基酸种类

甲基化发生的氨基酸上,您是不是觉得很简单,不就是K或者R上吗?告诉您,不止这些。

甲基化可以发生在Arg, lys, Asp, Asn, Gln, His, Glu和cys上,或者是蛋白质的N末端或者C末端上。按照甲基结合的位置,可以分为以下三种类型,分别是N-methylation, O-methylation, S-methylation。感兴趣的童鞋可以见下面的图一。但是在体内最常见的还是N-methylation类型的甲基化,所以研究最多的还是甲基化类型还是发生在lys和Arg两种氨基酸上。所以您如果要做质谱鉴定分析,需要提前确定好您做的是那一类型或者那些氨基酸上的及计甲基化修饰哟!


图一  甲基化修饰氨基酸类别

二:甲基化修饰类型

仅从分子量上考虑,甲基化修饰一般可以分为单甲基化(monomethylation),双甲基化(dimethylation),三甲基(trimethylation)三种类型,分子量在质谱上分别偏移+14.0157Da,+28.0313Da,+42.0470Da。从空间结构和能否发生的的修饰上来说,K上以上三种修饰均可发生,R上的修饰就比较特殊,包括单甲基(MMA),对称二甲基(SDMA),不对称二甲基(ADMA)三种类型,详见下图二,也就是说R上的氨基酸甲基化修饰有相同分子量的不同结构形式。这次您是否彻底明白了呢?

图二 甲基化修饰类型总结


三:甲基化质谱检测方法

甲基化修饰与其他翻译后修饰类似,在生物体内的丰度较低,如果直接进行酶解鉴定,可能信号会被淹没,很难检测到。针对甲基化修饰种类多,且丰度低的检测难题,CST公司开发了几种针对修饰基序的甲基化修饰抗体试剂盒,可以对特异的关注的甲基化修饰进行富集,然后再通过质谱检测。目前一共有四种甲基化的抗体可供选择,针对您不同的氨基酸或者是不同的修饰类型需求。

以上是甲基化的基本知识,您是否了解了呢?想做甲基化的童鞋,请速速来找中科新生命吧。中科新生命与CST联合,使用以上几种甲基化抗体试剂盒,妈妈再也不用担心,甲基化检测啦。

如果觉得意犹未尽,可以向中科新生命索要相关文献,进行更加深入的了解!


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