第四届中国药物基因组学学术大会暨_首届中国个体化用药—精准医学科学产业联盟大会
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【直播】颜真:无标记定量蛋白质组揭示胃癌分子差异与标志物研究

2017/10/28 来源:生物探索
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导读
10月28日,大会精彩继续。在上午“临床应用探讨”主题报告环节,第四军医大学药学院药物基因组学教研室/全军基因诊断技术研究所的颜真教授进行了题为“无标记定量蛋白质组揭示胃癌分子差异与标志物研究”的演讲,分享了他们在利用蛋白质组学平台,筛选与胃癌相关的生物标志物的研究心得。


2017年10月27-28日,西安全球硬科技创新大会首场论坛——第四届中国药物基因组学学术大会暨首届中国个体化用药-精准医学科学产业联盟大会在西安曲江凯悦酒店举行。本次大会以“药物基因组助力未来健康”为主题,吸引国内生命科学领域的多名院士、专家和企业界代表齐聚西安,就药物基因组学的前沿技术与产业落地进行研讨与交流。

10月28日,大会精彩继续。在上午“临床应用探讨”主题报告环节,第四军医大学药学院药物基因组学教研室/全军基因诊断技术研究所的颜真教授进行了题为“无标记定量蛋白质组揭示胃癌分子差异与标志物研究”的演讲,分享了他们在利用蛋白质组学平台,筛选与胃癌相关的生物标志物的研究心得。

以下为主题演讲概要:

胃癌是我国高发肿瘤,其发病的分子机制尚待阐明,相关预警、诊断、治疗、预后监测的生物标志物缺乏是阻碍胃癌防控的关键因素。我们的课题组应用无标记定量蛋白质组技术,分析了配对的手术切除患者的胃癌-癌旁组织蛋白表达谱,鉴定获得146种差异表达蛋白,对这些差异分子进行生物信息学的分析,发现其中的117个分子和肿瘤相关,99个与胃肠道的疾病相关,这些分子主要参与了细胞的生长、增殖,核酸代谢等等功能。进一步分析发现这些蛋白分子参与了多个信号通路,可以形成相互作用的一个网络,并呈现三个主要的动态簇。主要以核酸结核蛋白为主,还有能量代谢,细胞机制蛋白合成相关蛋白。

把核酸结合分子群放大以后,我们发现它的中心是YBX-1,周围围绕多个核不均一的核蛋白,我们从中选择了四个分子进行了进一步的验证,这四个分子是hnRNPA2B1、hnRNPD、hnRNPL和YBX-1。经过TCGN数据库的挖掘,我们找到421例胃肿瘤相关的基因组学的数据,发现这四个基因在数据库中基本以高表达为主。我们在胃癌的多个肿瘤细胞系和患者的肿瘤组织当中,也证实了这四个基因主要以高表达为主。通过免疫组化的分析,我们发现这四个基因,在肿瘤组织中主要分布在细胞核里,在癌旁组织中,胞核和胞质都有分布,文献检索提示这四个分子与多种肿瘤的发生发展都有关系,其中hnRNPD和hnRNPL,与胃癌的关系还没有被揭示过。

YBX-1是一个转录因子,多项研究都提示这个分子与癌症有明显的相关性,是癌症细胞生物学的一个主调控因子。hnRNPD主要表达于肿瘤细胞核,通过结合靶分子的mRNA而促进胃癌细胞增殖与迁移,促进细胞周期,抑制细胞凋亡,并通过YBX-1-PI3K/AKT/mTOR信号通路参与胃癌细胞的增殖,影响胃癌的发生发展。

hnRNPD是否能作为精准医学可用的一个分子标志物,我们做了一个很初步的组织芯片的表达分析。在75例胃癌生存信息的组织芯片中,分析RNPD高表达的23例患者和低表达的8例患者之间生存曲线,我们发现生存中位有明显的差异。但是这个分子要成为真正的标志物还有很长的路要走。

接下来我再介绍一下PLCE1分子,这个分子区别于PLC家族中其他分子的一个重要的特征是它的结构在N端和C端多了两个结构域,这可以使它定位在高尔基体上面,而且可以激活(英:RUA斯特)途径。2010年以来的GWAS研究提示PLCE1基因上的若干个SNP位点影响胃癌、食管癌的发生。我们的关联研究也显示PLCE1的SNPs与胃癌风险具有密切的相关性。

我们通过LC-MS/MS发现PLCE1在胃癌与癌旁组织的表达具有可变性,但rs3765524和rs2274223基因型影响PLCE1表达,minor型PLCE1表达明显高于野生型;minor型PLCE1 过表达可促进细胞增殖、迁移和克隆形成,促进EMT过程,并且与胃癌细胞对化疗药物(HCPT,DOXO,5-FU)的耐药相关。耐药形成与PLCE1促进DNA-PK表达、促进高尔基体重塑与分散相关,联合应用DNA-PK抑制剂可以逆转PLCE1相关的胃癌细胞耐药。该研究为胃癌的诊断和有效治疗提供了候选分子标志物。

备注:内容根据速记整理,未经嘉宾本人审核。

大会信息:

名称:中国药物基因组学学术大会暨首届中国个体化用药-精准医学科学产业联盟大会

时间:10月27日至28日,上午9:00-12:00,下午1:45-6:00

地点:西安曲江凯悦酒店大宴会厅

主办:中共西安市委、西安市人民政府、中国药理学会药物基因组专业委员会、中国个药联盟

承办: 西北大学、国家微检测系统工程技术研究中心、陕西基因检测精准医学示范中心、陕西佰美基因股份有限公司、陕西省国际医学交流促进会、西咸新区科统办

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