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Science:人类癌症病理图谱重磅发布

2017/08/25 来源:药明康德
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导读
最近,《科学》杂志发表了一项癌症基因组学的研究成果。瑞典科学家们完成了一项在癌症患者中的大型研究,他们通过超级计算机分析了17种常见癌症超过8000名患者的数据,建立了一个“人类癌症病理图谱”(Human Pathology Atlas)。

本文转载自“药明康德”。

每位癌症患者的肿瘤都带有独特的基因突变,每个突变都可能对肿瘤疾病发展和预后带来不同的影响。有的突变代表肿瘤更加恶性和富有侵袭性,而有的突变只会引起良性肿瘤,更好地了解患者的突变类型能够帮助医生寻找最佳的治疗方案。

最近,《科学》杂志发表了一项癌症基因组学的研究成果。瑞典科学家们完成了一项在癌症患者中的大型研究,他们通过超级计算机分析了17种常见癌症超过8000名患者的数据,建立了一个“人类癌症病理图谱”(Human Pathology Atlas),该图谱列出了数千个癌症相关的基因对患者生存的影响,以及潜在的新药物靶点。研究人员可以在网上公开访问这些信息(点击“阅读原文”即可访问)。


▲人类癌症病理图谱(图片来源:proteinatlas.org)

这个“人类癌症病理图谱”是多项正在进行中的对肿瘤公共数据库进行大数据分析的计划之一,这些数据库包括美国国家癌症研究所的肿瘤基因组图谱计划(National Cancer Institute’s Cancer Genome Atlas),它们收集了大量的癌症患者的基因组和临床信息。而科研人员希望通过分析这些数据来帮助开发更好的肿瘤诊断和治疗手段。

由Mathias Uhlen教授领导的来自瑞典皇家理工学院(Royal Institute of Technology in Sweden)的科研人员在研究中对8000多名患者的肿瘤样本进行了RNA测序和全转录组分析,也就是分析了每个基因所编码的蛋白在癌细胞中表达水平的变化。基因突变会增加或者减少蛋白的表达量,而不同蛋白的表达量又有可能积极或消极地影响患者的生存率。

研究发现,癌细胞中不同基因的表达量差异非常之大。同一种肿瘤不同患者中的差异甚至可能大于不同类型肿瘤之间的差异。这一现象强调了精准医学的重要性。针对每位患者特有突变的个性化医疗方案可能会带来最佳的治疗效果。

这个团队还发现了超过2000种可能影响患者生存率的基因。不过,这些基因的作用跟肿瘤类型和部位有关,有时候基因高表达对患者来说是好消息,而有时候则意味较差的预后。更重要的是,他们并没有发现任何一个基因对所有不同类型的肿瘤患者都会造成影响。总的来说,与细胞分裂相关的基因如果表达量升高,患者的生存时间会缩短。而促进细胞分化的基因如果表达量降低,也往往与较低的生存率相关。


▲17种癌症中发现对预后有利和不利的基因数目(图片来源:参考资料[2])

另外,Uhlen教授团队找到了超过2000个能抑制肿瘤的生长的基因,这些基因有可能成为新药研发的靶点。但是这些基因大多在正常组织中表达,靶向其中很多基因也可能带来许多副作用。最后,他们预测了32个潜在的跨肿瘤类型的药物靶点,这些基因的变化在超过80%的各种肿瘤患者中被发现。

基因测序公司Illumina的肿瘤学副主任John Leite博士表示,想要了解癌症的形成机制,并最终使研究人员和医生预测每位患者的最佳治疗方案,需要大量的生物学信息。这就是这个“图谱”可以帮上忙的地方。

参考资料:

[1] A Cancer “Atlas” to Predict How Patients Will Fare

[2] A pathology atlas of the human cancer transcriptome

[3] The Human Protein Atlas

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