高通量测序平台:专注环境微生物多样性检测分析,真细菌和新菌16s鉴定
www.mymbio.com · 2017/07/20
环境微生物群落多样性分析, 基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量测序平台,对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等,比如16S/18S /ITS某个高变区域的序列,来反应环境样品在细菌、真菌、古菌分类方面物种之间的差异,对研究海洋、土壤、肠道粪便等环境中的微生物构成有重要的指导作用。揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系。探讨微生物多样性,对于研

环境微生物群落多样性分析, 基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量测序平台,对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等,比如16S/18S /ITS某个高变区域的序列,来反应环境样品在细菌、真菌、古菌分类方面物种之间的差异,对研究海洋、土壤、肠道粪便等环境中的微生物构成有重要的指导作用。揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系。探讨微生物多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。
16S rDNA测序:16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,采用MiSeq测序仪,对16S rDNA某个高变区进行测序,进一步做环境微生物中细菌或古菌多样性分析。
18S rDNA测序:18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区,保守区反映生物物种间的亲缘关系,高变区反映物种间的差异。
ITS 测序:ITS分为两个区域:ITS1/ITS2,ITS1位于真核生物核糖体 rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于真核生物核糖体 rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或者ITS2进行测序,进一步做环境微生物中真菌多样性分析。

技术路线:

样品要求:
1、环境样品(请使用干冰或者冰袋运送)
1)土壤≥5g
2)粪便≥2g
2、DNA样品(请使用使用干冰或者冰袋运送)
  1)总量≥150ng
   2)浓度≥5ng/μL
   3)有明显主带,无降解,无RNA、蛋白质等杂质污染。

提交的结果与资料有:
   (1)提取DNA后的质检报告;
   (2)实验数据报告;
   (3)所有的测序结果与分析结果。
北京地区客户我司安排业务人员上门洽谈取样,外地客户联系客服确定后,样本采用邮寄形式。









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