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液体活检又亮了!新研究展现ctDNA五大潜在临床价值

2016/11/11 来源:生物探索
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导读
在一项新研究中,研究人员用了五种不同的方式来展示循环肿瘤DNA潜在的临床价值——量化肿瘤负荷、识别疾病亚型、分类突变、预测疾病的转变以及早期预测疾病复发,看来液态活检真是不简单。


肿瘤循环DNA(ctDNA)基因突变检测对肿瘤靶向治疗、早期治疗应答评估和耐药监测的实时评估等都具有一定的临床应用价值。由于组织样本的局限性,临床上逐渐开始使用患者血浆中的游离DNA进行肿瘤基因突变的检测。基于ctDNA的液体活检也是近年来比较热门的领域,不断有突破性的成果呈现。

11月9日,坦福大学医学院的研究人员在《 Science Translational Medicine》杂志中表示,对淋巴瘤患者血液ctDNA进行测序,可以准确地确定癌症亚型以及引起耐药性的突变位点,这有助于揭示哪些患者有可能被成功治疗,哪些患者的预后较差,从而有助于实现癌症的个性化治疗。

追踪基因序列随时间的变化,可为癌症的发展提供实时的早期预警。这项研究进一步支撑了当下流行的观点——基于ctDNA的液体活检给癌症治疗带来变革。“如今我们可以确定肿瘤的亚型,可以观察它是如何随时间改变,能够基于基因突变来决定是否进行化疗”,本文作者之一,医学助理教授 Ash Alizadeh说,“我们不再是依赖于血液中肿瘤DNA的数量来判断疾病的轻重。”

“在这项研究中,我们用了五种不同的方式来展示ctDNA潜在的临床价值——量化肿瘤负荷、识别疾病亚型、分类突变、预测疾病的转变以及早期预测疾病复发”,本文的另一位作者,放射肿瘤学助理教授Maximilian Diehn说,“我们迫不及待在最近被诊断的患者中进行这项前瞻性研究,以确定如何更好地提高对病人的护理。”

92例患者的前瞻性研究


研究人员对92例弥漫大B细胞淋巴瘤患者进行了前瞻性研究。弥漫大B细胞淋巴瘤是非霍奇金淋巴瘤中最常见的类型,并且具有高度的生物变异性,因此不同患者对治疗的反应会有很大的差异。大约三分之一看似成功治疗的患者最终会复发,或者肿瘤出现抗药性。另外,发展缓慢且只有轻微症状的惰性B细胞淋巴瘤,可以在没有任何预警的情况下发展成为侵袭性肿瘤。

“这种转变是很难察觉的,通常需要侵入性的活检来诊断”,Diehn说,“我们的研究表明,一个简单的血液测试就能够监测疾病随时间发生的变化,或许还有助于在更早的时间识别出疾病的转化。”

研究人员开发了一种增强版的技术——CAPP-Seq,利用它从血液样本中分离并测定ctDNA。以往的研究通过监测与癌症相关的蛋白来追踪淋巴瘤的进展,但该研究中的CAPP-Seq技术能够识别肿瘤基因组中更大范围的突变。

随后,研究人员将血液样本中的ctDNA序列与组织活检肿瘤细胞中的DNA序列进行比较,并将序列信息与患者的疾病以及治疗结果相配对。他们发现,经诊断但治疗前低水平的ctDNA与患者的无进展生存率(PFS)密切相关。此外,他们在疾病复发临床症状出现前6个月以及复发信号释放前2.5年,检测到患者血液中与疾病复发相关的ctDNA的存在。

确定癌细胞的起源、预测预后

该研究还有一个更加重要的结果——能够确定癌症的起源和预测预后。大约三分之二的生发中心型(germinal center subtype)患者在诊断后能存活五年以上,而活化B细胞型肿瘤患者对当前治疗方案的预后较差。这些亚型对新兴的靶向治疗有不同反应是已知的,但是要准确预测这种差异是很难的,需要进行活组织切片检查。

最后,研究人员能够在临床症状出现以前,从ctDNA序列中预测哪些患者的疾病会发展成为侵袭性更强的疾病,甚至还能识别和跟踪一些抑制药物靶向治疗(如 ibrutinib)的特定突变。该研究只是斯坦福大学关于精准医疗的一个子项目,它们的目标是对健康人群经预测和预防疾病,对疾病人群进行精确的诊断和治疗。

参考文献:

Distinct biological subtypes and patterns of genome evolution in lymphoma revealed by circulating tumor DNA

DNA sequencing determines lymphoma origin, prognosis

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