SNPs的检测方法课件(适合SNP初学者)
易生物实验 · 2010/03/15
SNPs的定义 定义:单核苷酸多态性 ( single nucleotide polymorphisms ,SNPs) 主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。 (99.9%) SNPs的研究意义 1. SNPs作为第三代遗传标记(已知性、可遗传性

SNPs的定义

定义:单核苷酸多态性 ( single nucleotide polymorphisms ,SNPs) 主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。 (99.9%)

SNPs的研究意义

1. SNPs作为第三代遗传标记(已知性、可遗传性、可检测性),用于疾病基因的定位、克隆和鉴定。___路标的作用

传统研究策略(表征、蛋白、基因)

逆向遗传学(表型、基因、蛋白),

2.基因多态性研究

研究SNPs本身对机体的影响(生理特征、病理条件下的千差万别)

(实际上1和2两者并不能截然分开,有可能研究的SNPs所在基因就是疾病基因,当然也可能只是在附近而已。)

SNPs研究进展和方向

1. SNPs数据库的构建发现

2. SNPs功能的研究(在1的基础上)

一是SNP数据库的构建,主要目的是发现特定种类生物基因组的全部或部分SNP;二是SNP功能的研究。大规模SNP数据库构建只是基因组序列分析中心可以胜任的工作,常规实验室是不太可能进行该工作的。但我们应该注意到,发现SNP只是SNP研究的第一步,而SNP功能的研究才是SNP研究的目的。染色体DNA特定区域的SNP的功能研究是很多分子和细胞生物学实验室可以进行的工作。特定DNA区域的特定SNP在特定群体的序列验证和频率分析及SNP与特定生理/病理状态关系的研究是SNP研究的主要方面。

SNPs检测方法

1.理想的检测SNPs的方法

——发现未知的SNPs,或检测已知的SNPs

(1) 灵敏度和准确度的要求(反应原理严紧)

(2) 快速、简便、高通量(操作和分析的自动化程度高)

(3) 费用相对低廉

SNP 检测方法的发展趋势

一个理想的检测SNP 的方法必须具备以下优点: (1) 适合自动化操作,简便、迅速; (2) 分析费用低,特殊试剂用量少; (3) 反应要严紧,即使不纯的样品也可得到可靠的结果; (4) 数据分析简单,易于自动化分析; (5) 反应的通量要大而灵活,一天可以完成几百到上百万个样品。

2.现状:

到现在还没有一个符合以上条件的理想方法出现,但根据实际情况,可以选择出较合适方法。

3.每种SNPs的检测方法都可将之看成由区分SNPs特异位点的原理方法和数据的检测分析手段两部分组成。

SNPs检测方法的分类

一、区分SNPs 位点的方法

1.基于杂交的方法

原理:短的核苷酸探针在和互补的目的片段进行杂交时,完全匹配和有错配两种情况下,根据杂交复合体稳定性的不同而将SNPs 位点检测出来。 (差异越大,检测的特异性就越好)

……………………

2.基于酶的方法

3.以构象为基础的方法

4.直接测序的方法

二、检测分析技术

1.凝胶分析技术

2.荧光检测技术

3. DNA 芯片

4.质谱检测技术

所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。如若转载请联系原作者。
  • 2019/12/13
    近日,一项新的研究确定了大脑中改变食物冲动性的特定回路,这为科学家有一天有可能开发出解决暴饮暴食的疗法提供了可能性。这项发现于近期发表在《nature communications》杂志上。
  • 2019/12/13
    《Science》杂志上报道了一项新的细胞应答筛选技术——sci-Plex,可以收集不同的细胞,并显示被药物处理时单个细胞发生的变化,相比于目前典型的高通量化学筛选法(HTS),不只局限于粗略的读数,或特定的分子发现,这为探索药物机制提供强有力的数据。
  • 2019/12/13
    斯坦福大学医学院最新研究发现,c-Jun(与生产性T细胞活化相关的AP-1家族转录因子)的功能缺陷介导了“疲惫”的T细胞的功能障碍,研究人员基于此开发出了一种减轻这种疲劳反应并改善CAR-T细胞抵御血液癌和实体瘤的活性的方法。
查看更多
发表评论 我在frontend\modules\comment\widgets\views\文件夹下面 test