Cell:不依赖于DNA突变的新型血液检测,攻破液态活检的局限性
2016/01/19
日前,《Cell》中的新研究揭示了克服液态活检检测范围局限性的新方法,开发出了依赖于核小体中DNA折叠的新型血液检测技术,可扩大液态活检的诊断范畴。


液态活检是检测患者血液中的游离DNA以诊断或检测疾病的进展,在过去几年中,液态活检引起了分子诊断领域的一场变革;然而尽管液态活检展现出巨大优势,但其可检测范围仍然是有限的。

在华盛顿大学的一项新研究中,研究人员表明通过确定释放游离DNA的细胞类型来克服液态活检的局限性是有可能的。然而,有趣的是新方法依赖于个体游离DNA的分裂模式,并将这种模式与各种生理状况有关的细胞凋亡做比较。该文章以《Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin》为题发表于《Cell》上。

本文作者霍华德休斯医学研究所Jay Shendure博士说,“我们的研究揭示了通过寻找分裂模式(而非依赖于寻求DNA突变)来确定游离DNA的组织来源是有可能的。”每个细胞中含有大量的通过反复折叠的DNA。DNA盘旋缠绕着核心组蛋白八聚体形成了核心蛋白。核小体如珠子随着基因组延伸。人体内每个细胞的DNA折叠方式都有差异,这些差异可使游离DNA带上标记。

华盛顿大学的研究人员推测可用这种方法来确定游离DNA的发源地。在细胞死亡的过程中,DNA被酶切成很多块(切断核小体之间连接脆弱的DNA片段),先前研究指出,人类基因组核小体容易被切断的位置总共有1300万个。

作者写道,“通过对血浆中的游离DNA进行深度测序,我们制成了有机体内核小体的全基因组图谱,同时发现游离DNA碎片蕴藏了转录因子的印迹。游离DNA核小体包含率(nucleosome occupancies)与细胞中核体结构、基因结构与表达密切相关,并可揭示细胞类型的起源。”

研究人员表明,不仅不同癌症有不同的核小体DNA指纹,通过这些指纹还能鉴别出肿瘤的解剖源。Shendure博士说,“这与5%的起源未知的转移性癌症尤其相关,这种测试可有助于诊断未知癌症的类型并给与治疗指导。”

该研究团队认为这种方法可用于诊断大量的疾病,同时具有有一个优势:在基因学上相同的细胞中也起作用。作者最后总结道,由于这种方法不依赖于不同组织之间的遗传差异,因此可广泛用于临床疾病的非侵入性检测。

所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。如若转载请联系原作者。
  • 2018/06/12
    这是无创检测领域的一大新突破!来自斯坦福大学等机构的科学家们开发出了一种适用于孕妇的血液检测技术。该技术不仅能够以75%-80%的准确率预测孕妇是否会早产,还可以评估胎儿的胎龄(或孕妇的预产期)。尤其值得一提的是,这种新型血液测试与现在常用的超声波技术一样可靠,且价格更便宜。
  • 2018/02/02
    在过去的15年里,世界各地的科学家们一直在寻找一种简单的痴呆症血液检测方法。最近,Nature杂志发表了一项突破性成果:来自日本和澳大利亚的科学家小组开发了一种血液测试,可检测与阿尔茨海默症相关的毒性蛋白,且测试的准确率高达90%!
  • 2017/12/08
    行业所瞩目的医疗技术公司BD与本土高新技术企业上海伯豪生物技术有限公司(以下:伯豪生物)于12月1日宣布签署一项战略合作协议,由伯豪生物负责其独创的“大肠警哨”血液基因检测核心技术,由BD提供高质量的试剂配件和全自动分子工作站的双向支持
查看更多
  • Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin

    Nucleosome positioning varies between cell types. By deep sequencing cell-free DNA (cfDNA), isolated from circulating blood plasma, we generated maps of genome-wide in vivo nucleosome occupancy and found that short cfDNA fragments harbor footprints of transcription factors. The cfDNA nucleosome occupancies correlate well with the nuclear architecture, gene structure, and expression observed in cells, suggesting that they could inform the cell type of origin. Nucleosome spacing inferred from cfDNA in healthy individuals correlates most strongly with epigenetic features of lymphoid and myeloid cells, consistent with hematopoietic cell death as the normal source of cfDNA. We build on this observation to show how nucleosome footprints can be used to infer cell types contributing to cfDNA in pathological states such as cancer. Since this strategy does not rely on genetic differences to distinguish between contributing tissues, it may enable the noninvasive monitoring of a much broader set of clinical conditions than currently possible.

    展开 收起
发表评论 我在frontend\modules\comment\widgets\views\文件夹下面 test