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Nature2015最佳评论文章出炉,中国2篇文章、3名科学家入选

2015/12/22 来源:生物通/叶予
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导读
Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点,评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章,他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路,以及云南大学的研究员马晓娅。


Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点,评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章,他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路,以及云南大学的研究员马晓娅。

Computational biology: How to catch rare cell types


北京大学的研究员汤富酬

汤富酬和文路在这篇文章中重点介绍了Grün等人开发的RaceID的算法,该算法能够在复杂的细胞混合物中有效鉴定稀有细胞类型。

Grün等人从体外培养的小鼠“迷你肠”获得238个细胞,并对它们进行了单细胞转录组测序。然而,标准聚类算法无法鉴别稀有细胞(分泌细胞谱系)中的亚类。他们为此开发了一种聪明的算法,RaceID。

RaceID假定给定细胞类型强力表达一些特异性的“异常值”基因。只要仔细排除技术和生物学噪音,就可以从测序数据中鉴定到这些基因。Grün等人通过RaceID鉴定了新的分泌细胞亚型,并且在体内验证了它们的存在。

汤富酬和文路在文章中指出,通过研究者们的不懈努力下,不久的将来我们将能绘制完整的人体细胞谱系图。

云南大学马晓娅:怪诞虫的头

Palaeontology: Hallucigenia's head

绝大多数主要的动物类群首次出现在化石记录里是在寒武纪,这些化石对于理解早期生命的起源和演化特别重要。云南大学的马晓娅博士是这一领域的专家,她受邀为一项寒武纪怪诞虫头部细节构造的新发现撰写了评论文章。怪诞虫(Hallucigenia sparsa)是寒武纪最著名动物,Smith和Caron描述了这种动物的新解剖特征,彻底阐明了其头尾定向问题。研究显示,这种动物具有一个细长的头部,头上有一对眼睛,它的口器被硬化的片状结构保卫,咽部排列着咽齿。这些形态特征是蜕皮动物所特有的,而蜕皮类动物是动物界里最丰富的一个类群。马晓娅博士在文章中指出,寒武纪叶足动物是蜕皮类动物进化历史中承上启下的一个重要过渡类群。

其他生物类评论文章

Stem cells: Asymmetric rejuvenation

赫尔辛基大学的Anu Suomalainen在这篇文章中介绍了Science杂志上的一项重要干细胞研究。这项研究显示,干细胞的不对称分裂对子女是很不公平的。一个子细胞遗传了母亲的永生能力,另一个子细胞必须离开舒适的干细胞巢分化为特定细胞类型。研究人员发现,干细胞将线粒体不对称地分配给两个子细胞,干细胞继承者获得绝大多数新合成的线粒体。

Suomalainen指出,线粒体借助氧燃烧脂肪、糖类和氨基酸,这一过程生成被称为活性氧(ROS)的副产品。ROS是一种强力信号分子,过量的时候会产生危害。如果线粒体蛋白功能健全,那么ROS产量是很小的。正因如此,干细胞特别重视这个细胞器的健康。此外,ROS增加与细胞分化有关,线粒体不对称分配有助于起始细胞分化程序。

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