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二代测序2016新品巡礼(上)

2016/03/07 来源:生物通
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导读
二代测序市场如今异常繁荣,但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动二代测序的进一步普及,让样品制备成为日常的流水线工作。


二代测序几乎影响了生物学领域的每一个角落,科学家们用这一技术测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控和探索微观生命。二代测序市场如今异常繁荣,但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动二代测序的进一步普及,让样品制备成为日常的流水线工作。

Illumina

一月中旬,Illumina公司的测序产品线增加了新成员。这是一款简单经济的新测序平台——靶向测序系统MiniSeq。MiniSeq系统基于Illumina现有的测序技术,能开展各种DNA和RNA靶向应用,从单基因测序到通路测序。这款仪器比MiSeq小44%,2x150 bp双端运行能产生7.5 Gb的数据。

作为Illumina公司新的入门级测序仪,MiniSeq准备在本季度开始发售。该产品的目录价为49,500美元,大约是MiSeq价格的一半。Illumina公司还提供了多种高通量和中通量试剂盒供客户选择。据介绍,MiniSeq将在“低价格、低通量”的领域开辟一个新的市场,特别适合适合分子病理学家、转化和临床研究人员、以及小型实验室。

Illumina公司的CEO Jay Flatley还在AGBT上介绍了一项名为萤火虫的计划,公布了他们正在开发的半导体测序系统。该系统包含两个盒子,一个用于文库制备,一个用于测序。这套系统可以直接放在桌面上,使用iPad作为用户界面。

半导体测序系统每次运行可产生1.2 Gb的数据,将是“最完整的测序仪”。这套系统准备在2017年下半年上市,售价将低于30,000美元,每个样品的耗材成本接近100美元。它将是众多市场的理想选择,包括科研、肿瘤学、传染病、遗传病和生殖保健。

Pacific Biosciences

Pacific Biosciences公司在去年九月份发布了自己的新测序仪,Sequel系统。Sequel仍然采用PacBio经典的长读取技术,但体积和重量仅为PacBio RS II系统的1/3左右,价格也降低了一半(目录价$350,000)。由于ZMWs数量从15万提升至100万,Sequel产出的数据通量提升到了RS II的七倍左右,Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach介绍道。

能用RS II的实验同样也能在Sequel系统上运行,只不过速度更快价格更便宜,Korlach说。Sequel系统还能搞定那些用RS II显得有点慢或者有点贵的研究,比如从头装配植物和动物的参考基因组,以及群体遗传学研究。

从一月份发布的数据来看,Pacific Biosciences公司在2015年年底已经接到了49台Sequel系统的订单。

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