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“癌症基因组学云”项目:七桥公司公开数据再吸金4500万美元

2016/02/21 来源:生物探索
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导读
癌症基因组学云试点项目用于建设癌症基因数据库,为研究人员提供安全的数据访问权限,实现基因组数据访问的更加开放。2月16日,七桥公司宣布利用开发的癌症基因云,向科学家们提供直接途径来使用世界上最大的基因数据组:癌症基因组图谱(TCGA),并成功完成4500万美元的A轮融资。

七桥基因组学公司580万美元中标“癌症基因组学云”项目

2014年,美国国家癌症研究所(NCI)推出“癌症基因组学云试点项目”(Cancer Genomics Cloud Pilot),对参与该项目的美国哈佛-麻省理工博德研究所、美国系统生物学研究所和七桥基因组学公司(Seven Bridges Genomics,SBG),分别资助700万美元、650万美元和580万美元,用于建设癌症基因数据库,为研究人员提供安全的数据访问权限,实现基因组数据访问的更加开放,并提供一个更具成本效益的方式,为癌症研究团体提供计算支持。其中,七桥基因组学公司在“癌症基因组学云”项目中包括外显子组、全基因组、转录组分析,并提供免费的工具并帮助设计数据分析流程。

2月16日,七桥基因组学公司宣布利用开发的癌症基因云,向科学家们提供直接途径来使用世界上最大的基因数据组:癌症基因组图谱(TCGA),也提供了用于分析这些数据的计算资源。

癌症基因组图谱(TCGA)的十年

癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目在2006年首先作为试点项目,任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,旨在对癌症生物学获得新的见解,可能用来开发更好的治疗方法。TCGA数据已被用来寻找新的突变,定义固有的肿瘤类型,确定泛癌症的异同,揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。

近10年以来,项目总投资共有3.75亿美元,TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。它的20字节数据包括1000万个突变,到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,并被数百篇论文引用。这些惊人的数字反映出项目的指数增长,通过样本收集、测序和分析技术的快速发展,这一切都成为可能。

NIH的测试建议:在一个或多个云试点环境安装新的分析工具,以测试其在大的基因组数据库性能或进行新的研究;本地上传基因组数据到一个或更多的云环境中,并结合癌症基因图谱计划(TCGA)的数据进行分析;还可使用云平台中的工具或用户安装工具对TCGA数据处理、分析。

七桥基因A轮融资4500万美元

2月16日,七桥基因宣布完成A轮融资,由专注于数据驱动型前沿科技创新的国际投资基金Kryssen资本领投4500万美元。前者打造的云平台系统让这些数据的协作使用和分析成为可能,这种协作甚至能快速分析数以百万计的基因组,以及各类生物医学的海量数据。

此外,公司顾问委员会又新加盟两位成员:前美国参议院多数党领袖汤姆·达施勒,以及前谷歌大中华区总裁李开复。成立于2009年的七桥公司在贝尔格莱德、伦敦、旧金山和麻省剑桥均设有办公室,服务于政府、医药和科研实验室,其中包括两个世界上最大的基因组项目:美国国家癌症研究所(NCI)的“癌症基因云”项目,以及英国“英格兰基因组”的“十万基因组”计划。

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