Oxford Nanopore:纳米孔测序仪开放试用
ebiotrade · 2014/02/01
在近期举办的美国人类遗传学协会年会上,英国Oxford Nanopore Technologies公司曾宣布将启动MinION测序仪的试用计划。MinION试用计划已经启动,将延续到2014年初。根据这项试用计划,参与者须支付1000美元的押金以及运费,而后将收到一台MinION测序仪,包括测序USB装置、流动槽和软件。


在上个月的美国人类遗传学协会年会上,英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次,它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。

根据这项试用计划,参与者须支付1,000美元的押金以及运费,而后将收到一台MinION测序仪,包括测序USB装置、流动槽和软件。

除了MinION测序仪,Oxford Nanopore还在开发GridION测序仪。之前,该公司一直没有公布这两款测序仪的具体性能参数,但鉴于许多客户有意了解,它最近在网站上回答了一些常见问题。

GridION和MinION系统的通量如何?

据介绍,GridION系统是可以扩展的。它既可以单独作为一台仪器工作,又可以多台连接,带来更快的结果。至于仪器的通量,它会受到各种因素的影响,包括DNA的处理速度以及芯片上同时开展的实验数量。第一代商业化的仪器每天可产生几十Gb。目前的cartridge每次可开展2000个纳米孔实验,而更高配置(每次开展8000个实验)正在开发中。

MinION系统是个一次性的设备,每次可开展数百个纳米孔实验,运行时间为数小时。

运行时间如何?

Oxford Nanopore表示没有固定的运行时间,这要取决于实验需求。由于全长的读取数据是实时流出的,故也能实时分析。初步分析可在每台仪器(节点)上本地开展,而二次分析可在用户的网络上并行开展。因此,MinION和GridION节点可持续运行,直到收集了足够的数据来回答实验问题。

系统的读长是多少?

据介绍,纳米孔测序仪是处理提交给它的DNA,而不是“产生”读长。它能够处理非常长的读长,大约几十kb。

GridION和MinION系统的费用如何?

相信这也是大家最关心的问题。Oxford Nanopore表示,GridION技术的定价不同于传统的系统。它是一个套餐,包括节点和cartridge耗材。这些套餐可满足不同需求及不同预算的客户。例如,有些客户可能有比较多的经费,而另一些则在耗材花费上更为自由;定价将让这两种类型的客户都能使用。

此外,GridION系统的定价将比目前市场上的其他系统都要低。此系统是模块化的,用户可不断添加。无需服务器,因为每个节点都包含了所需的计算硬件。而且,定价透明,可在线下单。大的套餐也会有透明的折扣。

对于MinION系统,零售价预计在900美元以下。不过,目前还未开始接受订单。

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  • 2016/06/02
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  • 2015/03/11
    从2005年454公司首推新一代测序仪以来,转眼已是10年光阴。在这10年间,许多新平台问世,有的昙花一现,illumina从小鲜肉变成了帅大叔,10X Genomics在JP摩根大会成为了最大的黑马,并从AGBT大会起航,跃居为夜空中最亮的那颗星星,MinION也成为了科研人员追逐的小鲜肉。
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