第四届中国药物基因组学学术大会暨_首届中国个体化用药—精准医学科学产业联盟大会
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国家基因库今日正式运营,系全球最大,比银行金库还贵

2016/09/22 来源:
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导读
国家基因库于9月22号正式运营,这将是中国首个获批筹建的国家基因库,同时也是目前为止的唯一一个。该基因库由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、原卫生部联合批复,并由华大基因最终负责承建运营。


据《朝闻天下》报道,总部位于深圳的中国国家基因库今日正式运营,这也是继美国、日本及欧盟后的第四个国家级基因库,也是目前为止,全球最大的基因库。

国家基因库


图片来源:华大基因

2011年01月,国家发改委批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库。同年10月,国家基因库建设方案由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、国家卫生和计划生育委员会四部委批复。国家基因库基地位于深圳市大鹏新区大鹏街道下沙片区“禾塘仔”地块,一期建筑面积47500平方米。

国家基因库将建成国际一流水平的高效基因信息数据库、可溯源性生物样本资源库,制定基因信息数据和生物样本采集、储存和管理相关标准和技术规范;通过国际、国家行业高标准,参与国际、国内联盟合作,发挥互补性优势,围绕生物医药、生物农业和海洋生物等生物产业重点领域搭建基因资源挖掘的基础性支撑平台;保护我国珍贵且特有的遗传资源,实现基因及数据资源共享利用,提高我国基因组数据的储存、分析和管理能力,进而推动生命科学和生物产业发展,把握未来生物经济的战略优势,充分保护和利用我国基因战略资源。

国家基因库采用基因信息数据库和生物样本资源库相结合的建设模式,以“存、读、懂、写、用”为建设目标,打造既有数据又有可溯源实体样本的新一代基因资源库、信息库、知识库和工具库。旨在保护我国珍贵且特有的遗传资源,实现基因及数据资源共享利用,提高我国基因组数据的储存、分析和管理能力,进而推动生命科学和生物产业发展,对于抢占未来生物经济的战略制高点、掌控基因战略资源,具有极其重要的战略意义。


图片来源:国家基因库官网

系全球最大,比银行金库更加宝贵

当前,全球范围内已有的基因库有美国国家生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA数据库(DDBJ)。在世界范围内,之前最大的基因库是美国的NCBI,但中国国家基因库的吞吐量将达到美国的NCBI同等规模,此外还包含了样品库和活体库等,它将成为规模最大的综合性数据库。

对于中国国家基因库与其他国家基因库的不同点,国家基因库执行主任徐讯介绍到,“跟他们相比,我们的实际上是综合性的基因库,他们的实际上是单一能力的数据库;第二,他们的这些数据库都是以科研为主,主要是科学家产生一些科研数据,但我们的这个数据库,不仅仅有科研数据,还有产业的数据,它不仅仅面向科研,同时也面向产业,给产业机构提供服务和支持。”

国家基因库分两期建设,即将开幕的是一期,工程投资7.8亿元,建筑面积4.75万平方米,目前基因信息数据总量达60PB,生物样本存储能力1000万份。

从架构来看,国家基因库将打造“三库两平台”,三库由生物信息数据库、生物样本资源库和生物活体库组成,两平台为数字化平台及合成与基因编辑平台。

生物资源样本库主要收集植物、动物、微生物、海洋多样性、人类遗传、疾病等资源,现已实现了3000万份可追溯源、全类型样本存储能力;获得了2项地方标准,通过ISO9001、14001、18001、17025多项国际质量体系认证;为样本提供了四种储存选择,分别是4 冷库、-20 冷库、-80 冷库和-200 液氮储存,储存温度越低,成本越高,不同的样本选择不同的“居住场所”。

生物信息数据库目前已建成20Pb数据的可访问能力,规划二期完成500Pb的可访问能力。20Pb是什么概念?相当于四千万部电影!一个人一天看一部电影至少需要10万年才能看完。生物活体库致力于打造成为中国诺亚方舟,目前重点项目已启动瑞丽植物园数字化项目等,保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源。

9月22日,是国家基因库正式运营的第一天,有5Pb的数据正式对外发布,提供数据检索和查询功能。目前,数据产量将达到每年5Pb,相当于一千万人产前筛查的数据产出规模,升级后的系统,预计年产出数据可达10Pb。

生物信息库-数据库列表


图片来源:国家基因库官网

带来深远的影响

华大基因董事长汪建表示,“进入生命时代后,基因是最重要的,基因的保存,基因的读取,是未来生命发展的核心,所以他一定成为中国未来社会发展的一个非常重要的基础能力,所以我们把国家基因库,当做国家的一个宝库,来认真负责地把它运营起来。”

对于国家基因库给每个人带来的意义,徐讯在接受媒体采访时曾表示它将会有两个方面的意义,首先是在罕见病诊断和治疗领域,可以从基因数据上实现集中管理和追本溯源。另一方面是细胞样品的保存,它使每个人都有了“基因银行”。国家基因库作为公共平台,提供包括干细胞和免疫细胞保存的平台。一方面利用于科研和应用的转化,另一方面如果个人使用,也能具有银行的功能。

基因库的更长远意义在于对基因测序有进一步的推动和发展,还将推动基因的进一步解读和利用。在农业时代,一个国家拥有的耕地越多优势越大;在工业时代,拥有的石油、矿产等能源越多优势越大;而在生命时代,拥有更多的基因资源同时能对基因资源进行认知和利用,则意味着优势更大。

目前国家基因库已与多个国外国家级历史博物馆、挪威世界末日种子库等机构建立合作,正式运营以后也将与国际DNA数据库三方组织一样开放共享平台。

备注:本文整合自朝闻天下、国家基因库官网、华大基因、新浪科技等

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