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首个生物医疗开放大数据研究中心在沪成立

2016/03/16 来源:科学网
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导读
3月12日由华东理工大学信息学院、梅斯医学主办,主题为“开放•链接•服务”的2016生物医疗大数据研讨会暨华理-梅斯生物医药开放链接大数据研究中心成立仪式在华东理工大学举行


3月12日由华东理工大学信息学院、梅斯医学主办,主题为“开放•链接•服务”的2016生物医疗大数据研讨会暨华理-梅斯生物医药开放链接大数据研究中心成立仪式在华东理工大学举行,来自复旦大学、交通大学-耶鲁大学联合生物统计中心、中科院系统生物学重点实验室、曙光医院、万达信息等高校、科研机构、医疗机构和企业的300余位专家学者与会,围绕大数据开放与共享、数据关联,大数据关键技术与大数据在生物医药行业应用等话题展开研讨。

同时,研究中心还向参会代表赠送了基于RDF(Resource Definition Framework)格式,关联基因、药品与疾病的约1个G的开放链接数据(Linked Open Data)集合。互联网+时代,大数据被认为是改变行业的关键节点,生物医疗行业亦不例外。

据华东理工大学阮彤老师介绍,近年来,生物医疗行业的海量数据迅速形成,但相对于国外大量开放链接数据集对生物医药领域研究的促进发展,国内的生物医疗行业数据封闭、分散且表示方式不一致,制约了整个行业的发展。为此,华东理工大学信息学院携手上海梅斯医学,在上海市经济与信息化委员会指导以及上海市大数据联盟的大力支持下,成立了“生物医药开放链接大数据联合研究中心”,旨在充分发挥双方优势,提供开放的中文基础生物医药数据,关联国内外已有的生物医药开放链接数据,搭建生物医疗大数据研究公共服务平台,为生物医药大数据挖掘工作提供更多的支撑和服务。

“医疗大数据与精准医疗的联姻,为实现健康医疗的精准预防、精准治疗、精准预后等提供了可行之路。”华东理工大学刘昌胜副校长表示,近年来,生物医疗行业的海量数据迅速形成,同时,伴随着大数据处理关键技术的突破、数据开放等契机的发展,大数据将在促进行业发展中发挥重要作用。梅斯医学董事长张发宝认为,当前卫生信息化建设的发展很快,与医药相关的行业数据正在以前所未有的速度增长,大数据应用也已起步,开放医药大数据的研究已成为热点,一些国际著名大学着手成立大数据研究机构,但是,在数据利用、技术应用等多方面仍然面临诸多亟需解决的问题。据介绍,生物医药大数据挖掘是生物医药与信息技术的交叉学科。

在大数据挖掘方面,华东理工大学拥有计算机科学、数学以及统计学等学科优势,学生团队曾荣获2014年百度知识图谱数据分析竞赛一等奖,2015百度大数据竞赛一等奖及特别贡献奖,并且在西班牙举办的2015年语言学链接开放数据竞赛中夺魁。目前华东理工大学正与曙光医院、万达信息、上海申康合作,共同承担国家863项目“心血管疾病与肿瘤疾病中西医临床大数据处理分析与应用研究”。华东理工大学在生物医药的相关研究领域工作中也取得了一系列成果,在药物化学领域顶级期刊——美国《药物化学》杂志上发表的研究论文数量也领先于国内其他高等院校。按论文发表数量衡量,在国际Top10研究机构中,在“基于结构的药物设计”领域中与美国普渡大学并列第三。上海梅斯医药科技有限公司作为国内最大的医药生物和医疗健康产业服务平台,提供专业医药生物信息服务、临床医学研究协助服务、临床研究成果转化服务等。特别是在医学领域具有核心的资源,在临床医学领域具有强大的学术团队。

据悉,华理-梅斯生物医药大数据研究中心,将从开放链接大数据和专注多元化开发模式等方面为进一步推动生物医药大数据的发展开展相关研究。通过开放链接大数据 实现“开放•链接•服务”。基于基础知识图谱、提供数据下载、浏览、查询、问答、语义标注等技术服务,并在此基础上,提供电子病历数据质量检测、疾病分类、药品成分查询等业务服务。为社会公众提供健康指导,为医疗与医药企业提供专业信息服务。在未来三年内能为政府公共卫生系统提供辅助决策咨询服务,为医院、医药企业提供疾病知识库、药品知识库等的查询服务、辅助治疗服务。通过共享、反馈,促进知识库的更新和发展,依托于上海大数据产业创新联盟与中关村大数据联盟,联合各类医疗机构与IT机构,形成生物医药开放大数据社区,进而逐步实现“开放•链接•服务”的服务理念。专注多元化开发模式加速生物医药大数据创新。利用异构数据抽取、整合、处理技术,知识图谱技术,语义标注技术,医药大数据挖掘技术的研究及算法并行化改造技术,语义质量控制技术等生物医药领域的关键技术展开研究。通过创新基地建设,有效解决现有系统封闭、资源分散等问题,大幅提升成果快速转化扩散能力。

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