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全球最大的癌症药物研发3D数据库问世

2016/01/09 来源:生物探索
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导读
日前,研究人员完成了癌症研究与药物研发数据库canSAR的重大更新,为其增添了3D功能,该数据库是一个巨大的、公开的癌数据库,涵盖了生物学、化学、药理学及结构生物学,以帮助研究人员进行实验数据解释,更好地进行药物开发,目前canSAR数据库已成为全球最大的癌症药物研发3D数据库。


日前,研究人员完成了癌症研究与药物研发数据库canSAR的重大更新,为其增添了3D功能,该数据库是一个巨大的、公开的癌数据库,涵盖了生物学、化学、药理学及结构生物学,以帮助研究人员进行实验数据解释,更好地进行药物开发,目前canSAR数据库已成为全球最大的癌症药物研发3D数据库。

来自英国癌症研究所的研究团队在《Nucleic Acids Research》杂志上描述了对canSAR数据库的更新,其中最为显著的是添加了错误蛋白的3D结构以及癌症通讯网络图谱,其他的改进包括添加了更好的浏览器和搜索工具、新的疾病摘要和癌症列表,并增加了批量分析工具。

本文资深作者,canSAR数据库开发创始人Bissan Al-Lazikani博士说,我们的目标是让癌症科学家拥有所需的数据进行生命挽救。canSAR数据库自2011年以来已运行5年,旨在使用“大数据”来详细描述人类分子的行为。该数据库已包含数十亿的试验数据,反映了上百万种药物或蛋白对人类的影响,同时该数据库还附加临床试验的基因组数据信息。

Al-Lazikani博士解释到,“科学家需找到一个基因或蛋白缺陷相关的所有信息,以了解新药物是否起作用。然而这些数据庞大而分散,但canSAR数据库将这些数据聚集在一起,通过识别隐藏链接和提供关键信息来实现其价值。”

对canSAR的更新意味着在人工智能的帮助下科学家可在致癌分子表面寻找有用的生境,这些生境可能对癌症的发展起到重要的作用,目前该数据拥有近110000个致癌分子的300万个小生境的3D结构。该数据库的另一个新特点是科学家可识别肿瘤内的通信路径。Al-Lazikani博士表示该数据库是全球最大的癌症药物开发数据库,拥有来自175个国家的140000个用户。Al-Lazikani研究团队正在不断地更新该数据库,致力于定期开发新的人工智能技术以帮助科学家进行试验预测与设计。

英国癌症研究中心科学信息管理人员Kat Arney博士说,“削减时间和成本有助于新一代药物的开发,该数据库使世界各地的科学家能够使用大量详细的癌症科学信息,并可加快新药物的开发进程,最终挽救更多的生命。”

温馨提醒:canSAR数据库可通过英国癌症研究中心网址在线使用。

原文链接:

Cancer drug discovery gets a boost from large 3D database

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