NGS在多组学研究中的作用
生物谷 · 2016/03/03
人类进入21世纪以来, 生物学的发展已经全面进入到一个多组学时代。 包括基因组,转录组, 蛋白质组及代谢组学, 都是系统生物学的组成部分。 面对庞大的研究体量,基因测序技术是研究的基石。


人类进入21世纪以来,生物学的发展已经全面进入到一个多组学时代。 包括基因组、转录组、蛋白质组及代谢组学,都是系统生物学的组成部分。面对庞大的研究体量,基因测序技术是研究的基石。

NGS(Next Generation Sequencing)即下一代测序,又名高通量测序(High-Throughput Sequencing)是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的,该技术的飞速发展大大推动了组学研究。从测序技术发展本身来讲, 无论从测序片断的读长,速度,质量还是测序的时间、费用来说都有突飞猛进的改善。上世纪90 年代开始的人类基因组计划测序采用的是基于Sanger法的第一代测序,美,英,法,德,日,中国科学家用了10 多年的时间才完成了一个人类基因组的测序,花费三十亿美元。2011 年Life Technologies发布的Ion Torrent 个人化操作基因组测序仪(PGMTM)基于高通量化学技术的第二代测序,使一个人的全基因组测序时间缩短至几天,费用降到了数千美元。2012 年,Life Technologies又推出了基于半导体芯片技术的Ion Proton, 实现了以1000 美元成本在一天之内完成整个人类基因组的测序得梦想。现在基因测序已发展到单分子测序和纳米测序。在此基础上, NGS被应用于多组学研究的各个领域。在基因组学方面,有用来检测体细胞突变的全基因组测序技术和全外显子测序技术(Whole-genome &Whole-exome sequencing); 在表观遗传学方面, 有用来检测碱基甲基化位点的重亚硫酸盐测序(Bisulfite sequencing), 有用来分析组蛋白修饰的染色质免疫沉淀-测序(ChIP-Seq),分析染色质构造的DNase-Seq, FAIRE-Seq以及由特定转录因子调控的染色质相互作用的ChIA-PET;在转录组学方面,有以对mRNA和lncRNA 测序为代表的RNA- sequencing技术;在蛋白质组学方面,有研究蛋白质与蛋白质/DNA/RNA/ 化合物相互作用的体外病毒高通量测序(IVV-HiTSeq)技术和蛋白质间相互作用的酵母双杂交测序(Y2H-Seq)。

毋庸置疑,基因测序技术的每一次重大突破都促进了多组学的研究。不仅极大提高了研究的通量与发现速度,也带动了整个组学向精准医学方向的发展,最终为人类造福。

所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。如若转载请联系原作者。
  • 2018/11/20
    2018年11月20日,中国药品监督管理局(NMPA)通过创新医疗器械特别审批程序,正式批准艾德生物人类10基因突变联合检测试剂盒(维惠健™)用于定性检测非小细胞肺癌(NSCLC)、结直肠癌(CRC)患者EGFR/ALK /ROS1/RET/KRAS/NRAS/PIK3CA/BRAF/HER2/MET基因变异。
  • 2018/08/15
    近日,燃石医学和诺禾致源两款基于NGS的多基因肿瘤基因检测试剂盒相继获批,在业内引起了广泛的热议。8月14日,为进一步规范肿瘤相关突变基因检测产品的注册申报和技术审评,提高审评效率,统一审评尺度,国家食品药品监督管理总局和医疗器械技术审评中心发布关于公开征求《肿瘤相关突变基因检测试剂(高通量测序法)性能评价通用技术审查指导原则(征求意见稿)》意见的通知。
  • 2018/07/23
    7月23日,国家食品药品监督管理总局(CFDA)发布了《2018年07月23日准产批件发布通知》,其中由广州燃石医学检验所有限公司申请的“EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因突变联合检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”获得准产批件,该产品将成为中国首个获得CFDA批准的NGS肿瘤多基因检测试剂盒。
查看更多
发表评论 我在frontend\modules\comment\widgets\views\文件夹下面 test