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【干货】临床NGS基因检测产业调查分析报告

2016/02/23 来源:转化医学网
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导读
近日,市场研究和战略咨询公司DeciBio的研究者们通过对2012年至2015年间1000多篇论文和30篇专家采访进行了综合分析,总体来说,NGS临床应用的发展已超过预期,前景非常乐观。


近日,市场研究和战略咨询公司DeciBio的研究者们通过对2012年至2015年间1000多篇论文和30篇专家采访进行了综合分析,结果表明:NGS的临床应用正处于快速增长阶段,目前主要应用在肿瘤、罕见疾病和NIPT领域。在肿瘤领域,NGS主要用于能实施靶向疗法的肿瘤(如乳腺癌、肺癌、结直肠癌)中,帮助优化疾病的诊断与治疗。总体来说,NGS临床应用的发展已超过预期,前景非常乐观。见图1。

  

(图1)30位专家受访者情况

测序仪

对于测序仪产业而言,短期内,Illumina公司在NGS临床应用市场中仍处于主导地位;长期来看,NGS临床市场竞争日趋激烈,处于动态发展之中。纳米孔测序仪的精确性正在快速提高,并将带来颠覆性创新。鉴于其可扩展性,预测纳米孔测序仪的性能将很快能满足临床应用的需要,并有可能突破现有的技术(如边合成边测序技术)。部分受访专家表示对多种新型测序平台感兴趣(图2)。 

 

哈佛商学院教授 Clayton Christensen 提出颠覆性创新是一种与主流市场发展趋势背道而驰的创新活动,其颠覆威力极为强大,一般成果的企业都难以适应这类创新带来的挑战。

而纳米孔测序具有潜在的颠覆性创新特征(图3)。 

 

临床应用

通过对1285篇临床文献回顾,分析表明NGS不仅仅只应用于肿瘤和NIPT领域,还逐渐涉及病毒、微生物、免疫等研究领域。另外,全基因组测序、全外显子组测序仍是主要的应用手段,而靶向测序的使用份额正逐年大幅增加,见图4。  


部分专家认为未来5年临床肿瘤NGS检测的数量在一些顶级中心或增涨7倍。见图5。

  

技术挑战

大多数受访专家认为,NGS产业面临的挑战主要集中在上游和下游环节。上游环节包括:提高自动化的样品制备方案。例如,如何从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的样品以及液态活检样品中获得高质量的DNA。下游环节包括:提高意义不明突变的分析和报告质量,以及生物信息学解决方案。见图6。

  

行业分工

NGS快速增长的市场吸引了众多公司的参与。但提供测序技术的公司数量依然相对有限。提供样品制备、自动化或生物信息学解决方案的独立公司符合了市场的需求。尽管有多于150家公司提供DNA分析软件包,生物信息学的基础设施和分析工具仍不健全。 见图7。


  
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